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2012-02-23

BLASTL+の使い方

14:30 | BLASTL+の使い方を含むブックマーク BLASTL+の使い方のブックマークコメント

BLAST+の簡単な使い方のメモ

環境

BLAST+ 2.2.25

databaseの作り方

makeblastdb -in db.fasta -dbtype prot -out blast.db.fasta

相同性検索

blastp -query query.fasta -db blast.db.fasta -out output

今後の予定

BLAST無印で指定していたオプションがどれに変わったかちょこちょこ追加する予定

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