Hatena::ブログ(Diary)

それなりにマジメなメモ このページをアンテナに追加 RSSフィード Twitter

2012-05-01

SAMtoolsをコンパイルするときのメモ

11:49 | SAMtoolsをコンパイルするときのメモを含むブックマーク SAMtoolsをコンパイルするときのメモのブックマークコメント

Mappingのツールだと何かとお世話になるSAMtoolsをコンパイルしよとしたら意外に一発でコンパイルできなかったのでメモを残しておきます。

環境

Ubuntu 11.10

SAMtools 0.1.18

準備

Ubuntuに最初から入ってないものを幾つか使うようなのでそれのために予め以下のようにパッケージをインストールしました。

sudo apt-get install zlib1g*

sudo apt-get install libncurses5-dev libncurses5-dbg

すでにしばらく使ったUbuntuなので、標準で入ってなかったけどすでに入れていたため、今回はいれなくても大丈夫だったものがいくつかあるかもしれませんが、その時は適宜入れてください。

コンパイル

足りてないものがなければ以下のようにすればコンパイル完了です。

make

トラックバック - http://d.hatena.ne.jp/ang65/20120501/1335840583
リンク元