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arupaka-_-arupakaの日記

2012-05-22

サイトスケープでノードのサイズをファイルで指定する.

サイトスケープでノードのサイズ(大きさ)をファイルで指定する.

参考にさせていただいたブログ

http://wiki.livedoor.jp/bioinformatics/d/Cytoscape/Tutorials/Introduction_to_Cytoscape

(1)ネットワークを作る(このブログの昔の記事参照).

(2)File -> Import -> Attribute From Table で

   アトリビュートファイルを入力(一行目の扱われ方に注意、一行目が列名の場合は,一列目が列名という入力オプションにする)

(3)VizMapper のOptionボタン(Current Visual Styleの横にある

工具と鉄板のアイコン)をクリック

(4)Create New visual style: Visual Style名をつける

(5)Visual Mapping BrowserのNode sizeをダブルクリック

(6)(2)と対応する名前を選択

(7)Mapping Typeを Continuous Mapping を指定

(8)これでOK。

(9)できなければControl PanelのNetworkのタブを開き

   ネットワークを選び右クリックApply visual styleで名前をつけたものを選ぶ.

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これでなんとなくなるはず.

2010-05-04