「メトロイドプライムハンターズ」は、ゲームキューブで2003年、2005年に発売された「メトロイドプライム」「メトロイドプライム2 ダークエコーズ」と同じ主観視点型のゲームです。しかし、ゲームキューブ版が、探索・謎解きを中心とした「ファースト・パーソン・アドベンチャー」であったのに対して、このDS版は多人数対戦を前提とした「ファースト・パーソン・シューティング(FPS)」になり、「気軽」にシューティングが楽しめます。Wi-Fiコネクションや振動カートリッジに対応しているほか、DS初のボイスチャットも搭載しており、据え置き型ゲーム機やパソコンでFPSをプレイしているコアゲーマーも満足できる対戦仕様となっている。