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男には地図が必要だ。 荒野を渡り切る心の中の“地図”がな

2011-03-09

ABI3130で読んだシークエンスデータがFinch TVで見れない

ABI3100でもABI3130でもAB1というファイルが生成され、各ソフトで波形データが読める。

3runで合計48サンプル、3フォルダが生成。1つのフォルダに16個のサンプル。仮にこれを最初から順にフォルダ1、フォルダ2、フォルダ3とすると、フォルダ1は半分以上のサンプルが見れない。フォルダ2は16個全部見れる。フォルダ3では3割くらい見れない。こんな感じ。ファイルが壊れているようであるが、少し違うようである。こんなことはこれまでABI3100では一度もなかった。ABI3130を利用するのは今回が2回目であるが、1回目ではなかった。

  • 同じフォルダ内で見れるものと見れないものがある.
  • シークエンスの成否とは関係ないようである(見れるものでも失敗しているのがある).
  • 見れないファイルはSequence scannerでも見れなかった.
  • 両ソフトで見れないサンプルについて、BioEditで試すといくつかは見れたが、見れないサンプルもある
  • Bioeditで見れたものの中でも、シークエンスの成否は関係ないようである. つまりBioeditで見れたサンプルのいくつかは失敗していたし、いくつかは成功していた.
  • ソフトを閉じて再挑戦、コンピュータ再起動しても改善しない.

ChromasはDLできない。理由不明。4peaksはMacじゃないと使えない。

まぁなんかわかったら追記する。不便でかなわん。どうなってんだ。

追記:他の人に聞いても全然ならんし、おれ自身別サンプルもう一度やったら特に問題なかった。まぁたまたま何か調子悪かったのかな。

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