文献管理ソフトzoteroでCiniiの文献情報を取り込む方法をご紹介します。

zoteroとは何か

Firefoxの文献管理アドオンです。GoogleScholarやその他の文献ポータルサイト等で文献を発見したときに、アドレスバーに出るアイコンをクリックするだけで文献を登録できます。登録した文献もまとめて指定の形式で出力可能です。

zoteroのすばらしさについては、私が語らなくとも誰かが語っているはずなので、詳しくは以下をご覧ください。

• http://www.zotero.org/
• ブロガーに最適？参考情報を管理できるFirefox拡張『Zotero』 - POP*POP ? 世界のニュースをクオリティ重視で
• Dropboxがなくても大丈夫！Zoteroで論文管理 - どせいたんさき ２号。

問題：zoteroでCiniiの文献情報が取り込めない。

大体どんな文献ダウンロードサイトでも稼動しているzoteroですが、日本語文献を探す際に使うCiniiの文献情報を取り込んでくれません。*1

CiniiからRefer/BiblX形式ファイルをDLして取り込む方法もあるみたいですが、面倒。（さらに悪いことに正しく取り込まれない時がある）

そこで解決方法を探してみました。

結論

zoteroをベータ版にして、スクレーパ*2を書き換える

注意：ベータ版を導入するので注意事項をよく読んでね！

Zotero 2.0b の CiNii 対応。 http://bit.ly/DmzaH

[FirefoxProfilesPath]\zotero\translators\CiNii.js と差し替えれば OK です。

Twitter / 吉田光男: Zotero 2.0b の CiNii 対応。 ht ...

というわけで、導入方法は以下のようになります。

1. zoteroベータ版を導入する。
2. ここからjsファイルをダウンロード
3. zoteroの設定ファイルのあるところ（文献スクレーパがある場所）に先のファイルを上書き
4. Firefoxを再起動する

ファイルの上書き箇所ですが、zoteroの設定ページから確認することができます。

おまけ

これまでzoteroとDropboxで文献情報を研究PCと個人PCで共有していましたが、今回ベータ版にしたことで同期機能が使えるようになりました。

Dropbox無しでOKになったようです。

仲間と文献を共有できるグループもつくれるようです。誰かと共同研究されている方には便利かもしれませんね。

先日展示会のために作成したプログラムではたくさん輪郭抽出しています。

そのときはまってしまった恥ずかしいポイントをまとめておきます。

OpenCVで輪郭抽出するサンプルプログラム

サンプルプログラムはこのあたりを参考になさってください

opencv.jp - OpenCV: 木（Trees）サンプルコード -

cvFindContours (tmp_img, storage, &contours, sizeof (CvContour), CV_RETR_TREE, CV_CHAIN_APPROX_SIMPLE);

うん、輪郭抽出するのは、これだけなんです。これだけ。

白黒2値化されたtmp_imgの輪郭シーケンスをCvSeq型のcontoursに抽出します。

問題が発生する条件

輪郭を抽出するからには、輪郭に何らかの処理を加えたいと思うのが世の常です。

特に、プログラム中で何度も何度も輪郭をとることのほうが多いと思います。

このときに、CvSeqがCvMemStorageのなかに動的確保されていることを忘れると悲惨なことが起こります。

悲惨なこと＝メモリ関係の再現性のないバグが発生します。

• どちらかの解放を忘れるとメモリがいっぱいになって落ちるプログラムが生産できる。
• どちらかの解放をむやみに行うと再現性のないバグが発生し路頭に迷う。

当たり前といえば当たり前ですが、私ははまってしまった・・・・・！！！*1

問題を解決する

適切にCvSeqとCvMemStorageを確保/解放してあげればよい、ということになります。

まずは以下を読んで、メモリストレージについて理解を深めます。

opencv.jp - OpenCV-1.0:CXCORE メモリストレージ（Memory Storages）リファレンス マニュアル -

リファレンスによれば

CvMemStorage *storage = cvCreateMemStorage (0);

で使ったストレージ（親ストレージ）を使いまわして、CvSeqを確保/解放すると、メモリ領域に穴ができるらしい。

http://opencv.jp/opencv-1.0.0/document/opencvref_cxcore_storages.html

これを避けるためにはcvCreateChildMemStorageという関数を使って子ストレージを作ればよいらしい

CvMemStorage* cvCreateChildMemStorage( CvMemStorage* parent );

http://opencv.jp/opencv-1.0.0/document/opencvref_cxcore_storages.html

というわけで、プログラムをまとめると

  void main(){
        ・・・
    CvMemStorage *storage = cvCreateMemStorage (0);
        ・・・
    useContours(storage);
        ・・・
    cvReleaseMemStorage(&storage );
  }

  void useContours(CvMemStorage *parent_storage){
    CvMemStorage* child_storage = cvCreateChildMemStorage(parent_storage );
    CvSeq *contours = 0;
        ・・・
    cvFindContours (tmp_img, child_storage, &contours, sizeof (CvContour), CV_RETR_TREE, CV_CHAIN_APPROX_SIMPLE);
        ・・・
          輪郭を使って何かする
        ・・・
    cvReleaseSeq(&contours)
    cvReleaseMemStorage(&child_storage );

*2

まとめ

プログラム中で複数回 cvFindContoursを使う場合は、１つ親ストレージを作った後、cvFindContoursのたびに子ストレージをCreateChildMemStorageで作っては捨て、子供を作っては捨てするとよい。

参考文献

これにおせわになりました。ありがとうありがとう。

詳解 OpenCV ―コンピュータビジョンライブラリを使った画像処理・認識

• 作者: Gary Bradski,Adrian Kaehler,松田晃一
• 出版社/メーカー: オライリージャパン
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今年度納品実績

今年度（10月〜）の大学グッズ納品数。12月〆。

• ポストカード各種：各300枚
• ストラップ：合計300個(売り上げの7割が赤門タイプらしい）

というわけで5万円ぐらいいただきました。元手が回収できました。

お買い上げいただいた皆様、ありがとうございました。

来年度以降

取引先の生協の方に「個人なのにやたらうれている」という評価をいただき、

グッズを増やしてもらえるそうです。缶バッジの予定。

グッズが増えたらひよこコーナー作ってもらえるかも！やたー！

2010年は新しいサイトウサン・ひよこさんTシャツを作りたい！

↑こんなような、筆でかいた大味なTシャツにしたらどうだろうと思っています。

がんばる！

徐々にはじめていますが、インターネットを利用して高度にめんどくさく発達してしまったシステムですね。

以前の就活というのを知りませんが、少なくとも「このセミナーに申し込んで抽選に合格しないと、次の選考ステップにすすめない」などというゲームじみたものじゃなかったのではないかと思います。（紙と電話でこのめんどくさいことをできると思えない）

個人的には、勤務地が東京から通勤圏内で、そこそこ楽しく働けて、労働基準法をまもった会社であれば、あとは自分のがんばり次第で仕事は楽しくなるのではないかなあと夢想しているのですが、これもまたただの学生のたわごと。

ゲームははじまったばかりなのです。

今は選考に関係のない説明会ばかりでお客様扱いですが、この先どうなるか結構不安であります。

こんなかんじに、東大本郷キャンパス第二購買部（安田講堂脇）で販売中です！380円！

10月ぐらいに販売告知したのに、実際販売開始は11月でした。

なかなか製造してくれなかったのよね。

かなりの頻度で売り上げ状況をちら見しにいって、

観光客の後ろから買え買えオーラを出しているのは秘密だ！！！！

ちなみに今日みたところでは、赤門しか再販されていなかった。

制作展に最近研究で作ってるものを出展します!

会期情報

第11回　東京大学 制作展 （iii Exhibition11）

12月3日(木)〜12月8日(火) 11:00〜19:00　（土日もやってるよ！）

入場無料

レセプションパーティ　3日17時半福武ホールからスタート

http://i3e.iii.u-tokyo.ac.jp/i3e11/top.php

詳しい情報は公式Webページをご覧ください。

出展物

先生にえーという顔をされながらもかわいい研究をする！と言い張って、ネタだしを続けてきました。

最近折り紙に落ち着きました。

折り紙といっても難しいテクニックを使う折り紙ではなく、簡単に、適当に折ってもいい折り紙です。

折り紙というのは不思議なもので、折るだけでいろんなものができるのです。

その「いろんなもの」を生き物にしてしまおう！という作品です。

カニさんを折るとカニさんになります。

でも、適当に折ってもその形にあった動きをもぞもぞとするようなものです。

研究的には、一枚の紙を折る（=普通は直線）という制約条件で何かできないかなあと考えて作りました。

割と適当に折っても、人は「これはカニさんだ！」と人はわかる。

それを機械もできたらいいなって。

すごく難しい画像処理を使っているわけではないですが、

将来新しいインタフェースの入り口になったらよいなあと思って作りました。

ちなみに、ある条件をクリアーすると、ひよこ顔になる隠し要素を入れておきました。

よかったら探してください！

注文受付終了しました。

10個ひよこができたので通販します。

• 商品：羊毛ひよこストラップ（写真のひよこをストラップにしたもの。）
• 値段：1個500円。送料別途120円。
• 個数：一人1個。合計10個販売。
• 受付開始：本日10月16日22：00〜（それより前は無効）
• 初回限定おまけ：ひよこさん、東大にあらわるなポストカード2種

下記のフォームからご注文ください。

https://spreadsheets.google.com/viewform?formkey=dGhNZmV4Y28tZE9uUVNIZUtIOTM2UGc6MA