任天堂より1994年1月21日に発売されたスーパーファミコン用シミュレーションRPG。 開発はインテリジェントシステムズ。
ファイアーエムブレムシリーズの第3作目。
Wii/Wii Uのバーチャルコンソールで配信されている。
ファミコン版『ファイアーエムブレム 暗黒竜と光の剣』のリメイクである「第1部 暗黒戦争編 暗黒竜と光の剣」と、新作の「第2部 英雄戦争編 紋章の謎」の、2つの物語が収録されている。アカネイア大陸を舞台に、2度の戦乱に巻き込まれたアリティアの王子マルスの奮闘を描く。
マルスは『大乱闘スマッシュブラザーズDX』以降の大乱闘スマッシュブラザーズシリーズに参戦している。
2010年7月15日には、ニンテンドーDSでリメイク版『ファイアーエムブレム 新・紋章の謎 〜光と影の英雄〜』が発売された。