DNAの塩基配列を高速で読み取る装置の総称。Next-generation sequencing。 バラバラにした大量のDNA断片を並列して解析し、既存のゲノム配置と比較して再構築する手法が用いられる。 通常たんぱく質など、他の分子を解読できる機能も備えている。費用は1人当たり50万〜100万円程度。 2005年以降から実用化。イルミナ株式会社の「MiSeq」などが知られている。
次世代シークエンサー―目的別アドバンストメソッド (細胞工学 別冊)
2021.12.14 ウヒョー冷たいよー(>_<) 雨粒も大きいし、いくら貧乏病院だって 暖房くらい入れてますよ。 なのに、なのに暖かい所と寒い所がある。 こういうのって鼻粘膜弱いわたしは絶対やられるから、 Twitter上では新コロ君を分析した分析機や RT-リアルタイムPCRの事まで言って彼らのデマを見抜くので 絶対的マスクのガチガチコロナ脳に思われてますが、 実はマスク苦手系。 (ノーマスクの人たち、ほとんどが陰謀論のカルトだし、 こうなってもノーマスク掲げてるから 子供の鼻風邪なんてどうでもいいんでしょう。) 今はホントにマスクがはずせませんです 病院の玄関入って1mでAさんに 「さっ…
ここ数年、中国のゲノム関連企業であるBGIの次世代シーケンサーがゲノム解読に使われることが増えてきた。配列の増幅にローリングサークル複製機構を使っているなど、illumina社のシーケンサーとはだいぶシステムが異なるらしい。1当然、使われているアダプター配列も異なる。 アダプタートリミングツールであるTrimmomaticはデフォルトでillumina社の主要なシーケンサーに対応しているが、BGIのBGISEQやMGISEQを使用した場合は自分でアダプター配列を指定する必要がある。 検索するとアダプター配列の一覧がヒットし2、その中にアダプターを取り除くには以下の配列を使いなさいとあった。 >…
C797S耐性変異は、第3世代のEGFRチロシンキナーゼ阻害薬が開発された早々からよく取り上げられてきた変異です。 本変異をターゲットにした治療開発もずっと進められているはずですが、なかなか実用化されません。 今回の報告は、C797S耐性変異陽性患者は、 ・C797S陰性患者よりもオシメルチニブでの治療が長く続けられている ・新規病巣の出現を伴わず、1-数個の既存病変の悪化により病勢進行に至ることが多い という特徴があると言及しています。 C797S耐性変異に対する有効な治療がない以上、beyond PDでオシメルチニブを使い続けながら、増大傾向にあるオリゴ病巣を局所治療で制御する、という考え…
次世代シーケンサー(NGS)は遺伝子研究に革命をもたらしたが、生のシーケンサーリードの前処理は依然として重要なステップである。品質管理(QC)とトリミングのための既存のツールには限界があり、ワークフローが分断されている。本稿では、使いやすいインターフェースでQC解析、トリミング、フォーマット変換を統合した、包括的でユーザー中心のソフトウェアソリューションである123FASTQを紹介する。123FASTQは、既存のツールの利点を組み合わせると同時に、その限界にも対処している。洞察に満ちたビジュアライゼーションによるQC分析の改善、QC結果に基づく半自動トリミング推奨、さまざまなトリミングオプショ…
コンパニオン診断薬の世界市場は2022年に61億米ドルに達し、2030年には150億米ドルに達し、有利な成長が予測されています。コンパニオン診断薬の世界市場は、予測期間中(2023-2030年)に12.2%のCAGRを示すと予測されている。 コンパニオン診断薬とは、特定の薬剤や治療と並行して使用され、それらの治療から最も恩恵を受ける可能性の高い患者を特定するのに役立つ医療検査や医療機器を指す。これらの診断薬は、患者の特定の遺伝的または分子的特徴から、特定の薬物療法や治療法に適しているかどうかを判定するように設計されている。 コンパニオン診断薬の主な目的は、適切な治療を適切な患者に適切な時期に行…
市場概要 血液スクリーニングの世界市場は2022年にYY億米ドルに達し、2023-2030年の予測期間中にYY%のCAGRで成長し、2030年にはYY百万米ドルに達すると予測されています。 血液スクリーニング検査は、臨床使用のための汚染された血液や血液成分の流通を阻止するために、感染の兆候を特定するために実施される。血液スクリーニング検査は、病気の症状がない人々の潜在的な健康障害や病気を検出するために行われる。 血液スクリーニング戦略は、血液ユニットの安全性を保証するために設計されていますが、反応性の検査結果を献血者に通知するために使用すべきではありません。血液スクリーニング検査には、次世代…
市場概要 血液腫瘍検査の世界市場は、2022年に2億8,000万米ドルに達し、2030年には6億2,000万米ドルに達する好成長が予測されている。予測期間中(2023-2030年)の年平均成長率は4.8%である。 血液学は血液の生理学とそれに関連する疾患の研究であり、腫瘍学はあらゆる種類の癌の研究である。血液腫瘍学は、血液細胞、骨髄、および関連組織の癌の診断、治療、研究に関連する、これら2つの医学専門分野の重複である。 血液腫瘍学検査市場のダイナミクスと動向 がん患者の増加が、予測期間中の世界血液腫瘍学市場を牽引している。 がんは世界的な主要死因の1つであり、2020年には約1,000万人が…
市場概要 DNA検査市場レポートでは、市場シェア、市場規模、最新動向、今後の市場展望、競合情報などを分析しています。DNA検査の需要は、個別化医療や系譜学の発展により増加しています。特にアメリカやヨーロッパでは、医療分野からの需要が急増しています。イルミナ、サーモフィッシャーサイエンティフィック、キアゲンなどの大手企業が積極的に市場に参入しており、競争は激化している。 遺伝子検査として知られるDNA検査は、ヒトの遺伝子、染色体、タンパク質の変化を見つけることができる医療検査である。これらの変異は、その人が遺伝的障害を持っているかどうかを明らかにすることができる。また、DNA検査は、特定の病気…
世界のファーマコゲノミクス市場は、収益ベースで2023年に35億ドル規模と推定され、2023年から2028年にかけてCAGR 10.6%で成長し、2028年には58億ドルに達する見通しです。この新しい調査研究は、市場の業界動向分析から構成されています。この新しい調査研究は、業界動向、価格分析、特許分析、会議・ウェビナー資料、主要関係者、市場における購買行動で構成されています。市場の拡大は主に、ゲノムプロジェクトの急増、研究開発投資の増強、癌の有病率の上昇によって推進されています。さらに、過去10年間における薬理ゲノミクスの大幅な成長は、創薬および薬剤開発のためのトランスレーショナルリサーチの…
着床前遺伝子診断市場規模は予測期間2022-2029年に高いCAGRに達すると推定される 着床前遺伝学的検査は、体外受精(IVF)により作成された胚の遺伝的欠陥を検出するために妊娠前に使用される技術である。 市場動向 着床前遺伝子診断市場の成長には多くの要因が影響している。例えば、遺伝子検査における診断手順の進歩が市場を牽引すると期待されている。 遺伝子検査における診断手順の進歩が予測期間の市場を牽引すると期待される ゲノミクスにおける最近の多くの研究開発には、従来の「単遺伝学的遺伝学」から、超並列シーケンシングアプローチと高度なバイオインフォマティクスの統合によるヒトゲノムの包括的検査への進…
市場概要 世界の希少疾患遺伝子検査市場は、2022年に8億米ドルに達し、2030年には22億米ドルに達し、有利な成長が予測されている。世界の希少疾患遺伝子検査市場は、予測期間中(2023-2030年)に13.7%のCAGRを示すと予測される。希少疾患遺伝子検査市場は、ヘルスケア産業の中でも成長分野である。希少疾患に関連する遺伝子変異を特定するために、人のDNAを分析することが含まれる。 同市場は、各社が幅広い遺伝子検査サービスとソリューションを提供しており、高いレベルの競争と技術革新が特徴である。 世界の希少疾患遺伝子検査市場は、認知度の向上、政府による支援策、精密医療の範囲の拡大などに後押…
市場概要 オンコロジーコンパニオン診断市場は、予測期間(2023-2030年)中にCAGR 12%で成長すると推定される。 患者が特定の薬剤や治療法の良い候補者であるかどうかを判断する検査。例えば、コンパニオン診断検査は、患者の腫瘍に特定の遺伝子変化や薬剤が標的とするバイオマーカーがあるかどうかを判定することができる。この情報は、患者が薬物療法を受けるべきかどうかを決定するために使用される。 癌コパニオン診断薬市場のダイナミクス 世界の癌コンパニオン診断薬市場に影響を与える要因は、癌コンパニオン診断薬に対する需要の増加と有病率の増加です。 癌のコンパニオン診断薬に対する需要の増加は、予測期間…
市場概要 ESR1変異転移性乳がん診断薬の世界市場は、2022年にYY億米ドルに達し、2024-2031年の予測期間中にYY%のCAGRで成長し、2031年にはYY百万米ドルに達すると予測されます。 ESR1変異転移性乳がんは、ESR1遺伝子の変異を特徴とする乳がんのサブタイプを指す。ESR1はエストロゲン受容体α(ERα)をコードし、エストロゲンシグナル伝達経路において重要な役割を果たすタンパク質である。 ESR1遺伝子変異は、乳癌治療中、特に転移性乳癌において生じることがある。これらの変異は、エストロゲン受容体シグナル伝達を遮断するために一般的に使用されるタモキシフェンやアロマターゼ阻害…
市場概要 世界のバルデット・ビードル症候群診断市場は、2023年にYY百万米ドルに達し、2031年にはYY百万米ドルに達すると予測され、予測期間2024-2031年にYY%のCAGRで成長すると予測される。 バルデ・ビードル症候群(BBS)は、複数の身体系に影響を及ぼす遺伝的疾患である。古典的には6つの特徴によって定義される。BBS患者は肥満、特に腹部に沿った脂肪沈着に悩まされる。また、知的障害を伴うことも多い。一般的に、腎臓、目、生殖器の機能が低下する。BBSの人は手の指が1本余ることもある。BBSの重症度は、同じ家族内でも個人差が大きい。 BBSは一般に、網膜ジストロフィーによる視覚障害…
市場概要 腫瘍コンパニオン診断の世界市場規模は2022年に31億米ドルと評価され、2023年から2030年にかけて年平均成長率(CAGR)12.9で成長すると予測されている。次世代オミックスの時代における腫瘍学コンパニオン診断薬の役割の進化が市場を牽引すると期待されている。FDAは2020年1月以降、特定のCDxアッセイを使用した10種類の新しい併用療法や単剤レジメンを承認している。例えば、2022年11月、FDAはロシュが開発したVENTANA FOLR1(FOLR1-2.1)RxDx Assayを、ELAHEREの適応となる卵巣がん患者を検出するIHCベースのコンパニオン診断薬として承認…
前回は、染色体形成に働くタンパク質分子(団)こと「コンデンシン」の説明画像にたまたま線虫のみに見られる構造も掲載されていたことから脱線ネタで逸れてみた、生命科学を大きく発展させたスーパーモデル生物、「シー・エレガンス」について触れていました。 元々、「シー・エレガンスは、全ゲノム配列が判明している、数少ない動物のひとつなんですね(もちろん初めて全DNAが解明された、最初の種でもある)」という切り口で話を始めようと思っていたんですけど、「全遺伝子DNAの配列が完全に解明された生物のリスト」を見てみたところ、地味にめちゃくちゃ大量に存在していて、僕は配列解析が専門でもないので全然アップデートできて…
市場概要 バイオインフォマティクスの世界市場規模は2022年に101億米ドルとなり、2023年から2030年にかけて年平均成長率(CAGR)13.7%で成長すると予測されている。新薬の研究開発過程における需要の高まりや、研究開発活動を支援するための民間・公的資金投入の取り組みが、予測期間中の市場を牽引する主要因になると予想される。さらに、RasMol、AUTODOCK、BALL、Bioclipseのようなユーザーフレンドリーで入手しやすいバイオインフォマティクスソフトウェアの導入や、医薬品開発プロセスの初期段階における毒性検出を支援するバイオマーカー探索プログラムの正確かつ効果的な解析のため…