2001年1月の中央省庁再編に伴い、「重要政策に関する会議」の1つとして内閣府に設置された。 内閣総理大臣の下、科学技術政策の推進のための、日本国全体の科学技術を俯瞰し、総合的かつ基本的な政策の企画立案及び総合調整を行っている。