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LAPACK

(コンピュータ)
【らぱっく】

Linear Algebra PACKageの略．数値計算，特に線形代数的処理を行うためのライブラリ．BLASを基に作られており，そちらより高度な処理を行う．

  • 線形方程式系を解く
  • 線型方程式系の最小自乗解
  • 行列の固有値問題
  • 行列の特異値問題
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まぃふぇいばりっと•2年前

Julia言語 Randomized eigenvalue decomposition を実装した．

n×nの実対称行列Aの固有値を大きい順にr<n個得たいです．lapackを使うと val, vec = eigen(Symmetric(A), n-r+1:n) でOKです．この時，eigenの第一引数はSymmetric型じゃないといけないので注意．（ところで，ここでeigenではどんなアルゴリズムが動いてるんですかね？全部の固有値を求める方法は調べると出てきますが，大きい順に，っていう時は何が裏で動いているんでしょう．．．？知っている人がいたら教えてほしいです．） またArpackを使って， using Arpack val, vec=eigs(A, nev=r, which=:LR); …

#固有値分解#論文実装#行列分解#LAPACK#Julia lang

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まぃふぇいばりっと•3年前

Fortran90 Hofstadter's butterfly．六方格子系に垂直磁場．

六方格子系に垂直に磁場を与えることでHofstadter's butterflyが現れる． 昔かいたFortranコードを発掘したのでアップロード． 自然界に現れるフラクタル構造って良いですよね． ちなみに，Hofstadter's butterflyは六方格子系以外の系に垂直磁場を与えてもみられます． 作ったハミルトニアンをLapackで対角化しています． program zheevtest implicit none integer,parameter :: d=60 integer,parameter :: N = 2*d*d !対角化したい行列の次元 integer :: lda,lw…

#FORTRAN90#量子力学#物性物理#LAPACK
Yokaのブログ•24日前

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はじめに 色々あって、M1チップ搭載のMacBook Airを手に入れました。 自分自身、WIndows上で数値計算にC# + Math.NETを用いているので、Macでも同様にMath.NETを使って書いたコードを動かせるようにしました。 しかしながら、なぜかMath.NETのManagedコード*1しか動きませんでした。 しばらく格闘した末に、Math.NETでOpenBLASを使えるようにできたので、その記録を残します。 環境 チップ: Apple M1 メモリ: 8 GBつまりは2020年のMacBook Airです。 Math.NETの導入 Windowsで導入する場合と特に変わりま…

勉強しないとな～blog•1ヶ月前

OAK-D S2進める - HelloWorld

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ちょりが維持でも続けるやつ•6ヶ月前

おむらいすうま～

5:00頃起きた．ちょりです． 起きたらゲームよ．10:00前になるまでやってました． そっからは友達を駅まで迎え委に粋じゃ↓． その足で画国へ行きました．学校に先生おらんやろ午後からくるしなガハハとか思いながらYoutube開いて本読んでたら来ましたね．不意打ち． 18:00頃までLAPACKの本と戦ったりしてました．すこーーーしだけ動いs多 帰宅．飯． VALORANTを久しぶりにたくさん下 では おやすみなさい。

ちょりが維持でも続けるやつ•6ヶ月前

あそびた

びっくり八時起きでした．ちょりです． 今日はですね，セミナーなので学校行きます．でも午前中はゲームすると決めているのでスト6してました．かなしいことに1000LPほどとかしました．なぜ僕はゴールド目前までこれたのでしょう．みんなつよかった．手も足も出なかったり普通に変な感じに指が覚えてるせいで勝てません．強制しないといけないのでクラシックのほうがええんちゅか？ってなっては来てます．まだ間に合うかも． 午後になったので学校へ行きました．ゼミなーのほうはまぁいいとしてそのあとに活動としてLAPACKをいれる．そのためのsudo spt updateしてたんですけどもGPGエラー．許せん．よくわから…

SudachiTech’s blog•6ヶ月前

【試験研究】第一原理計算セットアップ（３）：サポートプログラムのインストール (Intel Compilers, wannier90, HDF5, libxc, etc.), (3) installing support programs and libraries for VASP 6.4.2

概要 vaspをコンパイルするために必要なソフトウェアのインストールを行う。 Intel Compilers: intel oneAPI HDF5 wannier90 libxc libbeef コンパイラインストール Intel oneAPI IntelコンパイラはIntel oneAPIというものに統合されており、無料でダウンロード、インストール、運用できるようになっていた。 これまでIntelコンパイラは、有料だったり、学生だけ無料だったり、お試し期間中無料だったりいろいろあったが、完全無料になったようである。 有料のものもあって、「商用優先サポート」が受けられるようです。 ダウンロード…

SudachiTech’s blog•6ヶ月前

【試験研究】第一原理計算セットアップ（５）：VASP.5.4.4.pl2のコンパイル（Intel Fortran版）, (5) VASP 5.4.4.pl2 compile by Intel oneAPI

概要 VASP5.4.4で十分な計算もあるので、インストールしておくことにした。MPI並列化版。 あっさりとバイナリが生成でき、それなりの速さで、過去に実行したことのある計算が高速に行えた。 インストール手順 Intel oneAPI BaseKit 2023.2, HPCKit 2023.2をインストール wannier90-3.1.0をインストール tar zxvf vasp.5.4.4.pl2.tgz cd vasp.5.4.4.pl2 cp arch/makefile.include.linux_intel makefile.include としておいて、makefile.includ…

SudachiTech’s blog•7ヶ月前

【試験研究】第一原理計算セットアップ（４）：VASP.6.4.2のコンパイル（Intel Fortran版）, (4) VASP 6.4.2 compile by Intel oneAPI

概要 VASP ver.6.4.2をインストールしていきます。 方法は、Vaspwikiの Installing VASP.6.X.X - Vaspwiki を参考に進めていけばいいことになっているが、うまくビルドするためには、typoも含めていろいろありました。 make testでvasp_ncl版の部分がすべてエラーになる。 ISIF=3の構造緩和計算がsegmentation faultになる。 mpirun -np 4で実行すると、やたらと遅い。 serial版のみがまともか？と思ってmake testしたらフリーズする。 という、どうにもならない状態がしばらく続きました。 それがあ…

The Nameless City•8ヶ月前

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言語特性 SASはプロプライエタリなソフトウェアで、お値段出せば統計解析のところはまあ全部入りという事は出来ます。また、大学では結構導入されている大学は多いので、ちゃんと使えば使えます。また、遺産は大きいです。 というか、まあ、遺産動かす為に導入しているところも多いのではないでしょうか。遺産のくせに毎年結構なお値段するのはなんともなあという気がしますが、その辺りを新しい言語とかにすると拾ってはくれませんのでどうしようもねえなという気がします。 しかも、正直使われてるのか微妙なライセンスもあるんだよなあ大学。 Rは、大学では使っている話は聞きます。また、WebでA/Bテストや！とか言っている人が…

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昨今LLMの台頭により、テキストをベクトル化して類似文書の検索に利用する手法が流行っています。 今回はAWSでこの検索を実現するための一方法として、SQLiteのプラグインであるsqlite-vssをAWS Lambda上で使う方法をまとめます。 github.com 意外とハマりどころや特有の考慮事項が多いので、必見です！ アーキテクチャ LambdaでSQLite？と思った方のため、このアーキテクチャの要点をまとめます。 このアーキテクチャのメリットは、完全なサーバーレスでベクトル検索を実行できる点です。OpenSearchやPostgres (pgvector)、Redisなどのインスタ…

chompooh’s diary•10ヶ月前

OpenCV／4.8.0のビルド

日本時間で6/29の午前２時頃でしょうか、OpenCVのver.4.8.0がReleaseされました。 github.com 自分の備忘録＋超初心者にもわかるように・を意識して手順を記録しておこうと思います。 CMake、Visual Studioは予め用意しておくこととします。 私の環境では、CMake 3.22.2、Visual Studio 2022 Professionalを利用しています。 はじめに、OpenCVライブラリのダウンロード。 今回はとりあえずCUDAとかQtとかは無しで、拡張ライブラリ（contrib）のみのシンプルなビルドを行いますので、以下リンクからzipファイルを…

MyEnigma•10ヶ月前

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理系大学院生の勉強、研究、日常etc...•10ヶ月前

NVIDIA,CUDAをインストールしてGROMACSをGPU上で動かす

NVIDIA * インストール済みNVIDIA,CUDAを確認 * Linuxに入れる推奨NVIDIAドライバを確認 CUDA NVIDIAとの依存関係のエラー GROMACS GROMACSのダウンロードからやり直す場合 他のトラブルについて 環境 Linux：ubuntu22.04 実行は2023年6月。 NVIDIA,CUDAをインストールしてGROMAGSをGPU上で動かす を目的とした記事です。 初心者向け解説追加&トラブル解決向けですので 基本はリンク先の記事通りに従えばうまく行きます。 NVIDIA, CUDAのインストールだけではトラブルは起きないと思いますが、GROMACSの…