2004年9月14日にアメリカのワシントンに、在外東トルキスタン人（ウイグル人）活動家によって設立された東トルキスタンの亡命政権である。1933年〜1934年と1944年〜1949年に存在していた東トルキスタン共和国との直接の連続性を標榜し、独立を目指し活動している。
一方、東トルキスタン亡命政府とは別個の亡命ウイグル人組織として、世界ウイグル会議がドイツのミュンヘンにある。東トルキスタン亡命政府が中国からの明確な独立を主張するのに対して、世界ウイグル会議はウイグル民族の民族自決権の確立を主張し、独立と高度な自治権確保のどちらが最終目標なのかについては含みを残している。
