YouTube動画をブックマークするときは「Share Details」の「Video URL (Permalink):」のURLにアクセスしなおしてから

YouTubeに限らずWebサイト側でPermalinkを提示しているときは、それが正しいURLだということなので。ソーシャルブックマークするときはアクセスし直してbookmarkletを使うか、提示されたURL文字列をコピペしてFormから入力したりしている。
こうすることで「正しいPermalinkを登録するマメな他の人」のブックマークを見つけやすくなる。
(まぁ本当だったら、SocialBookmarkURI-AutoDiscoveryみたいな規格で、機械の力で支援して吸収できればいいんだけどね。もっとも、Fragment等を含んだ特殊なURLをブックマークしたいときも有るだろうから、オートだけじゃなくてマニュアル操作でも登録できるのが必須という感じで)

追記

miyagawaさんのコメントを読んで検索してみた。

でa hrefタグに

rel="atom:link"

を付けたり。
ヘッダーで

link rel="canonical"

で指定するというアイデアだ。