Next-generation sequencing data interpretation: enhancing reproducibility and accessiblity

• High-throughput NGS を活用するための課題
• プラットフォームの違い、諸ステップの違い
• Reproduciblityの問題
  • プロトコールも変化し続けている
• 大規模データ処理に不慣れな「生物系」という問題
  • 大規模データに不慣れである、というそのこと自体
  • 処理を記載することに不慣れであると言う、別の問題
  • 研究結果公表時のデータと手法のフォーマット化した登録が必要
• 計算機インフラ
  • 大規模データだからこそ、大きなストレージ、大規模並列化などが重要だけれど、それを運用するスキル・人材は足りな過ぎる
• データの統合・提示
  • 以下、私見
    • 言うは安く…だけれど、「素晴らしい統合方法」と「素晴らしい提示」方法があって、それを見れば、「みんなが理解できる！」みたいな…
    • それには、「程度」「限度」があることは自覚が必要。その上で、「目指すべし」