packageの中にはクラス、変数、関数など何でも入る

そう、なんでも入るみたいです。逆にJavaのようにクラスのネストなんかはできません。
ただし、ファイル名と名前は一致している必要があります。

上のソース
Study04Namespace.mxml

<?xml version="1.0"?>
<mx:Application xmlns:mx="http://www.adobe.com/2006/mxml">
        <mx:Script>
        <![CDATA[
                import mx.controls.Alert;
                import sample.Study04NamespaceClass;
                import sample.Study04NamespaceFunc;
                import sample.Study04NamespaceVar;
        ]]>
        </mx:Script>
        <mx:Label id="sampleLabel" text="initialized"/>
        <mx:Button label="class" click="sampleLabel.text = Study04NamespaceClass.showClass();"/>
        <mx:Button label="func" click="sampleLabel.text = Study04NamespaceFunc();"/>
        <mx:Button label="variable" click="sampleLabel.text = Study04NamespaceVar;"/>
</mx:Application>

パッケージにクラスを入れた例
sample/Study04NamespaceClass.as

package sample {
        public class Study04NamespaceClass {
                public static function showClass():String {
                        return "クラス";
                }
        }
}

パッケージに関数を入れた例
sample/Study04NamespaceFunc.as

package sample {
        public function Study04NamespaceFunc():String {
                return "関数";
        }
}

パッケージに変数を入れた例
sample/Study04NamespaceVar.as

package sample {
        public var Study04NamespaceVar:String = '変数';
}

これらをコンパイルするときには下のコマンドで行います

mxmlc Study04Namespace.mxml

ただし、sampleパッケージのファイルはsampleディレクトリに入っている必要があります。