群集構造

カテゴリー：科学おもしろ話 はじめに みなさんは"Mother Tree hypothesis"（母の木仮説、母樹仮説）というのをご存知でしょうか。ドイツの森林学者ペーター・ヴォールレーベン（Peter Wohlleben）が書いた"The Hidden Life of Trees"という本 [1]（下図）で一躍注目の的となった興味深い仮説です。簡単に言うと、森の中で成熟した樹木（母の木）が、周りの子孫の面倒をみたり、樹木同士が互いの世話をするというもので、樹木の根をつなぐ菌根菌ネットワークで栄養のやり取りをしている、とされています。 本書は、ヴォールレーベンが管理するドイツ西部の町ヒュンメル…

日本エアロゾル学会による第40回エアロゾル科学・技術研究討論会が開催されました。 日時：2023年8月30日（水）～ 9月1日（金）場所：群馬県 美喜仁（ビキニ）桐生文化会館（桐生市市民文化会館） 今年は牧研からM1の学生が3名、研究発表で参加しました。 JR桐生駅 山崎：秋芳洞の鍾乳石を緑化させる光合成微生物の風送拡散の解明 田宮：森林において季節変化するバイオエアロゾルの微生物群集構造と雲形成の関与 藤原：黄砂煙霧とともに日本列島に拡散するバイオエアロゾルの微生物群集構造 ポスター発表では参加者からの質問に答えます。 そしてなんと！！ 2名がベストプレゼンテーション賞を受賞しました！ 学会…

新しい配列をリファレンス系統樹上に配置することは、環境サンプル、特にマイクロバイオームの解析にますます利用されるようになってきている。既存の配置手法は、クエリ配列がリファレンス系統上で直接特定のモデルの下で進化してきたと仮定している。例えば、単一遺伝子データ（16S rRNAアンプリコンなど）は、遺伝子ツリー上のGTRモデル（wiki）で進化したと仮定している。しかし、配置はより野心的な目標を持つことが多い: 進化モデルを知らないままで個々の遺伝子から得られたデータから（ゲノムワイドな）種のツリーを拡張することである。この困難な問題に取り組むには、新しい方向性が必要である。ここでは、Deep-…

手良村知功（てらむらあきのり） Akinori Teramura 1．研究 博士論文テーマ：深海性魚類の種及び遺伝的多様性に関する研究 概要：『日本近海太平洋岸および台湾の水深100m以深から記録されている1510種の分布記録をまとめ，階層クラスター分析によって日本近海における深海魚類相の特徴を明らかにした．次に，DNAバーコーディングやMIGseq法を用いたSNP解析といった分類群横断的なDNA解析手法を用いて種内の遺伝的多様性について調査した．最後にギンザメ類に注目した全ゲノム解析を行い，日本産ギンザメ科魚類のほぼ全種のゲノムを使った系統解析を実施した．』 現在取り組んでいる研究テーマ（2…