イントロン

概要 IL-6(物質)について概説する。 links インターロイキン-6 - Wikipedia インターロイキン6による神経系と免疫系の融合 : ライフサイエンス 領域融合レビュー Interleukin 6 - Wikipedia IL6 interleukin 6 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI Gene: IL6 (ENSG00000136244) - Summary - Homo_sapiens - Ensembl genome browser 103 IL6 - Interleukin-6 precursor - Homo sapiens…

「Modernaの最高医療責任者が『生命のコードを改ざんしている』と率直に述べた」という記事をイタリアのファクトチェック団体FACTAが検証「引用は事実だが、意味が誤って伝えられた比喩」 ファクトチェック記事（FACTA 2021.3.16） facta.news ファクトチェック記事翻訳。DeepLによる翻訳機能を活用していますが、翻訳機能が働かない場合や日本語が余りにもおかしい場合は当方で訳や注釈を付けております。大体の意味が通じるものはそのままにしてあります。 モデルナのタル・ザクスは「生命のソフトウェア」を操作すると言っていたが、それは比喩に過ぎない 2021年3月16日 2021年3…

真核生物のゲノムの転写には、RNAの複雑な代替処理が関与している。ロングリードを用いた完全長RNAのシーケンスは、処理の真の複雑さを明らかにする。しかし、ロングリードシーケンス技術の比較的高いエラー率は、イントロン同定の精度を低下させる可能性がある。ここでは、アライメントメトリクスと機械学習によって得られた配列情報を適用して、ロングリードのアライメントから疑わしいスプライスジャンクションをフィルタリングし、残りのジャンクションを使用して、2パスアプローチでの再アライメントをガイドする方法を紹介する。この方法は、ソフトウェアパッケージ2passtools（https://github.com/b…

ヒトとマウスのゲノムはほぼ同じ大きさで、ほぼ同じ遺伝子が含まれ、両方とも動く遺伝因子だらけである。しかし、マウスとヒトのDNAに見いだされる動く遺伝因子は、塩基配列は似ているが、分布が異なる。2つの種が分岐して以来久しく、それぞれのゲノムでこれらの因子が増え、動き回ってきたからである。 これに加え、過去7500万年の間に染色体の切断と組み換えが180回ほど起こったと推定され、染色体構造が劇的に変化した。ヒトでは大部分のセントロメアは染色体の中央付近にあるが、マウスのセントロメアは染色体の量末端にある。 あちこち混ぜ合わされたにもかかわらず、2つの種で同じ遺伝子群が同じ順序でつなぎ合わされている…

共生微生物からみた新しい進化学作者:政美, 長谷川発売日: 2020/06/22メディア: 単行本 本書はゲノム配列からの系統樹推定法などの研究で有名な遺伝学者長谷川政美による共生微生物をテーマにした一冊．長谷川は退官後，興味深い分野を一から勉強し，自身の進化生物学や系統推定の知見と絡めながら*1語ってくれる様々な本を刊行しており，本書もその一冊になる．共生微生物については，ヒトの腸内微生物がこれまで想像されていないほどヒトの健康や認知に大きな影響を与えていることが最近明らかになりつつあり，私も一度きちんと勉強したいと思っていたのでこれ幸いと手に取った一冊になる． 冒頭で「ヒトが自律した生き物…

エキソンの混ぜ合わせ 多くのタンパク質は、機能を持った小さなドメイン群から構成されている。真核生物では、こうしたタンパクドメインは通常、別々のエキソンからでき、それぞれは長い翻訳されないイントロンに挟まれている。真核生物の遺伝子のこの編成は、1つの遺伝子由来のエキソンを別の遺伝子に付加するエキソンの混ぜ合わせと呼ばれる過程により、新しいタンパク質の進化につながる。 こうしたエキソンの重複と移動は、遺伝子重複を引き起こすのと同じ組み換えによって促進されている。組み換えはエキソンの前後にあるイントロン内で起こる。現存のタンパク質にはいろいろなタンパクドメインを寄せ集めた構造が多数見られ、このような…

インターフェロン サイトカイン分泌炎症 出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 IFN-α (PDB: 1RH2). インターフェロン（英: Interferon、略号：IFN）とは動物体内で病原体（特にウイルス）や腫瘍細胞などの異物の侵入に反応して細胞が分泌する蛋白質のこと。ウイルス増殖の阻止や細胞増殖の抑制、免疫系および炎症の調節などの働きをするサイトカインの一種である[1][2]。 医薬品としては、ウイルス性肝炎等の抗ウイルス薬として、多発性骨髄腫等の抗がん剤として用いられている[3][4][5]。 ヒト白血球インターフェロン 概要 遺伝子組み換え型インターフェロ…

オモテ検査の抗A又は抗Bと微弱な凝集を示し、スライド法では凝集開始時間が明らかに遅延している場合、亜型の可能性があります。稀に血液疾患（AML、MDS等）の一部は、亜型と鑑別ができない程度まで抗原が減弱する場合もありますので、まずは被検者の背景（疾患、移植歴等）を確認する必要があります。典型的な亜型（A３、B３など）と抗原減弱を鑑別する際のポイントは２つ、①血漿中の転移酵素活性、②唾液中の型物質量、そして参考情報として、血漿中の不規則性抗A又は抗Bの保有の有無です。 ABO亜型の多くは、ABO遺伝子のエキソン６又は７領域の一塩基置換によるものが多数を占めます。その他にスプライシング部位の変異や…

遺伝子変動の生成 ・遺伝子内変異…単一ヌクレオチドの変化。あるいはヌクレオチドの欠失や重複によって変化することがある。遺伝子の転写産物のスプライシングを変えたり、作られるタンパク質や産物RNAの安定性、活性、局在部位、相互作用を変化させることがある ・調節DNAの変異…遺伝子の活性を調節するDNA塩基配列の変異により影響を受けることがある ・遺伝子重複…１個の細胞内に一連の近縁遺伝子群ができることがある。この細胞とその子孫細胞が分裂するとき、元のDNA塩基配列と重複配列がさらに変異し、新しい機能と発現パターンを持つことがある。 ・エキソンの混ぜ合わせ…２個以上の既存の遺伝子の切断と再結合が起こ…

次世代シークエンシング技術は、我々が生物系を分析する方法を変え、RNAシークエンシング（RNA-seq）が標準的な手順になった。ほとんどのRNA-seq実験はサンプル間の転写産物量を測定および比較を行う。これはさまざまな実験条件下で遺伝子発現プロファイルを分析するための重要なステップである。 2008年に、Mortazaviらは、mRNAの存在量を測定するために設計された正規化法を導入し、その尺度を「100万マップリードあたりのエクソンモデルのキロベースあたりのリード数」（RPKM）と名付けた（Mortazavi et al、2008）。これは後にTrapnellらによって修正され、「100万…

2021 1/8 誤字修正 大規模な並列シーケンシングの進歩とシーケンシングコストの劇的な削減により、RNAのディープシーケンシング（RNA-Seq）はRNA転写産物の同定と定量化のための主要なツールとなった。今日、RNA-Seqは、創薬標的の同定、新規遺伝子制御機構の予測などを目的とした研究において、細菌の遺伝子発現を解析するために広く利用されている。このような研究では、多くの場合、計算データの取り扱いと生物学の両方の深い知識が必要とされる。バイオインフォマティクスの中程度の知識しか必要としないスタンドアロンのパイプラインやツールがいくつかあるが、原核生物のRNA-Seq解析は、利用可能なほ…