ゲノム解析

インスリンの挙動をコンピュータでシミュレーションすることができれば、有機化学的証明をフィールド実験無しで実践することができた事になる。少なくとも生体実験を不要にするための第一歩になる。 インスリンとその受容体(レセプター)との間に何らかの阻害要因が存在することを確認するプロセスをシミュレーションできないか確認してみた。 結論としては、インスリン抵抗性を発生させるTNF-αなどがあるが、メカニズムは間接的なものであり、インスリン、レセプター、阻害要因の３者での挙動を確認するという発想自体が適切でないことがわかった。そのため、よりシンプルに考えるため、インスリンとレセプターの接続について次回に検討…

以下、サマリ(ChatGPT生成) 分子動力学へのAIの適応について議論しました。AIを利用することで、計算コストを削減し、シミュレーション速度を向上させる可能性があることを指摘しました。しかし、いくつかの注意点があり、機械学習モデルの精度、訓練データセットの範囲、力場の適用範囲、計算資源が重要な要素であることを説明しました。 その後、インスリンとインスリン受容体の相互作用解析に適した手法について議論し、混合シミュレーション法と機械学習による力場の開発・適用が比較対象となることを述べました。機械学習による力場が混合シミュレーション法に比べて優位性を持つかどうかは、注意点を考慮して慎重に評価する…

生体の物理的構造を理解することが重要なので、まずは基礎となるタンパク質の物理的特性をコンピュータでシミュレーションすることを考える。 Q:タンパク質の中で、最も単純な構造を持つものを教えて下さい。 A: タンパク質はアミノ酸がポリペプチド鎖を形成することで構成されていますが、最も単純な構造を持つタンパク質を特定するのは難しいです。なぜなら、タンパク質の構造の単純さは、その機能やサイズによって異なるからです。 ただし、一般的に小さなサイズのタンパク質は単純な構造を持つ傾向にあります。例えば、インスリンは、51個のアミノ酸からなる比較的小さなタンパク質で、A鎖とB鎖の2つのポリペプチド鎖から成り立…

組織工学について概要や事例をChatGPTに聞いたもの。 多面的な学問を総合することで実現し、様々な応用範囲があるが、Scaffoldの選択、血管網の生成、免疫応答の管理、実用化パイプラインの構築において課題が存在するとのこと。 組織工学（tissue engineering）は、生物学、材料科学、工学、そして医学の分野が交差する研究分野で、人工的に機能的な組織や臓器を作成する技術の開発を目指しています。組織工学の主な目的は、病気や損傷によって失われた、または機能不全を起こした組織や臓器を修復、再生、または置換するための治療法を提供することです。 組織工学は、以下の要素が一体となって機能します…

分析の結果、ベートーベンには肝疾患のリスクを示す遺伝子が存在し、長期間の飲酒とB型肝炎により肝臓疾患が悪化したため死亡した可能性が高いと推定されている。 過去にベートーベンが鉛中毒で死亡したとされる根拠となった毛髪は、ベートーベンのものではなく女性のものと明らかになり、鉛中毒ではなかったことも分かった。 >>毛髪は、ミイラでも残っているしね。 2000年はいけるのかな。 B型肝炎ねぇ。 記事入力 : 2023/03/24 07:30 「ベートーベンの死因は肝硬変」…毛髪をゲノム解析 ドイツの作曲家・ピアニストのベートーベンの死因が死後200年で明らかになった。 遺伝的要因、過度な飲酒、肝炎ウイ…

また厄介なことになっています。コロナはいつまで続くのか？ 中国がヤバいことになっているなぁとは思っていたが、これが各国に影響してきています。またウイルスの強毒化も心配されています。 しかも今回も隠ぺいしてます。本当に厄介な国です。日本も入国制限を実施するようだが、後手に回っています。 イタリアでは中国発の航空便２便においてコロナ陽性の乗客が半数にのぼった為、全数検査に切り替えたようです。またゲノム解析を行っているとのことなので、この後の発表が待たれます。 中国では新型コロナウイルスを徹底的に抑え込む「ゼロコロナ」政策を政府が突然撤回して以降、感染が急拡大しているが、その影響が国外にも出て来たと…

現在ヒトゲノムのほぼ全ての情報解読が終了し、遺伝子の役割と病気の関係の解明が進められています。 中国はこの分野に力を入れていて、先週上海でも新しいプランが発表されました「浦东新区促进细胞和基因治疗产业发展行动方案（2023-2025）」 個人でも手軽に受けれる遺伝子検査キットが販売していたので、どのような内容を検査できるのか試してみました。 遺伝子検査キットの購入 遺伝子検査キット 遺伝子検査結果 祖先分析 栄養・代謝について 健康リスクについて その他 遺伝子検査結果詳細レポート まとめ 遺伝子検査キットの購入 購入したのは「微基因WeGene」社の検査キット。「京东」で売上No.1だったの…

低進捗な日々。Miseqにも取り掛かれず、元素分析も終わっていない。というか、元素分析に関しては、装置の修理が必要という状況。前のラボと何も変わってないじゃん、と心の奥底で思う。一応、ボスが装置の修理はしていいよと言ってくれてるのが、唯一の救い。当たり前ではあるけど、前のラボはそれすらすんなり進まなかった。お金がなかったので。12月中にMiseqだけでもなんとかする予定。 月末は聴講だけではあったけど、微生物生態学会に行ったりしてきた。面白い研究もあった一方で、「類題を解いている」という感想を抱いた研究もちらほらあった。 面白いと思う研究は、新しい視点で世界を捉えようとする研究や実用を意識した…

note.com 今年の２月にケビン・マッカーナン (Kevin McKernan) 先生がコロナワクチンへのDNA汚染の発見を発表して以来、私はこの問題を非常に深刻なものと捉え、ブログ上でいくつもの関連記事を書いてきました。現在この問題は海外では大変重大なテーマとして取り上げられています。にも関わらず、日本ではコロナワクチン反対運動グループからも主だった問題として重要視する声は上がりません。ではそれは何故でしょうか？ 一つには、遺伝子についての話が難しすぎるという事もあるでしょう。専門分野の細分化が進む中、ほとんどの臨床医にとっても遺伝子は専門の範囲外となります。ましてやコロナワクチンの危険…

荒川央 (あらかわ ひろし) 1991年 京都大学理学部卒業 1996年 京都大学理学博士 (分子生物学、免疫学) バーゼル免疫学研究所 (バーゼル)、ハインリッヒ・ペッテ研究所 (ハンブルク)、ヘルムホルツ研究所 (ミュンヘン)、マックスプランク研究所 (ミュンヘン) を経て分子腫瘍学研究所 (ミラノ)所属 今年の２月にケビン・マッカーナン (Kevin McKernan) 先生がコロナワクチンへのDNA汚染の発見を発表して以来、私はこの問題を非常に深刻なものと捉え、ブログ上でいくつもの関連記事を書いてきました。現在この問題は海外では大変重大なテーマとして取り上げられています。にも関わらず、…

荒川央 (あらかわ ひろし) 1991年 京都大学理学部卒業 1996年 京都大学理学博士 (分子生物学、免疫学) バーゼル免疫学研究所 (バーゼル)、ハインリッヒ・ペッテ研究所 (ハンブルク)、ヘルムホルツ研究所 (ミュンヘン)、マックスプランク研究所 (ミュンヘン) を経て分子腫瘍学研究所 (ミラノ)所属 note.com 今年の２月にケビン・マッカーナン (Kevin McKernan) 先生がコロナワクチンへのDNA汚染の発見を発表して以来、私はこの問題を非常に深刻なものと捉え、ブログ上でいくつもの関連記事を書いてきました。現在この問題は海外では大変重大なテーマとして取り上げられていま…

NZの著名な医師で科学者のサム・ベイリー博士による、ウイルス学の嘘を徹底的に暴くシリーズ。今回は、NHKと大阪大学の中山英美准教授のグループが共同で撮影した「新型コロナウイルスとされるもの」の大茶番劇を取り上げています。 こうやってテレビやポータルサイトというプロパガンダツールを使い、日本国民に不安と恐怖を植え付けてワクチン接種奨励へと繋げていくのですなあ。NHKと阪大は罪深いよ。 そして日本、笑われているぞ恥ずかしい🤢 ウイルス学と新型コロナの偽科学に関して、日本が独自の描写をしているのは、意外ではありませんでした。例えば、2021年5月にNHKで全国放送された特別番組もそうです。 これは、…

ブラウザでリロードしながらキャッシュの挙動を確認してる全ての開発者へ | blog.jxck.io こども家庭庁が「子ども・若者４０００人が参画」とＰＲの看板政策、実際は最大５３３人にとどまる…政府関係者「かけ離れている」 僕が考える 「HTML サイトを WordPress にする」話 / 2023-11-05 Kansai WordPress Meetup 【速報】望ましい経済対策は「消費税の減税」41% JNN世論調査 | TBS NEWS DIG 旧統一教会トップ謝罪へ、最大100億円拠出案も 法的責任は認めず：朝日新聞デジタル [第23打]雀児 - 平岡一輝 | 少年ジャンプ＋ Do…

カズレーザーと学ぶ。遺伝子スイッチで寿命200歳！？最新ガン治療驚異の治験結果2022年10月25日放送 日本テレビカズレーザー 石川みなみ 斉藤慎二（ジャングルポケット） アンミカ 竹内由恵 おいでやす小田（おいでやすこが） こがけん（おいでやすこが）このテレビ番組では、遺伝子技術の進歩について様々な情報が紹介されています。ゲノム解析のコストが減少し、遺伝子研究の論文発表数も増えているとのことです。また、CRISPR-Cas9という遺伝子編集ツールについても言及されており、誰でも簡単にDNAを編集できる時代が近づいているようです。さらに、ヒトの遺伝子をサルの脳に移植し、認知機能を改善させる実…

絵：いらすとや www.nikkei.com www.youtube.com 古事記から日本書紀、日ノ本の記録空白の１５０年、藤原不比等の謎、伊勢神宮外宮の謎、出雲大社の疑問などなど… 神話に興味を持ってあれこれ調べて行くと、九州北部を経由して渡来人と縄文人の混血が進んだと言われる説や、邪馬台国が九州や西日本にあった説には、私は大いに疑問符が付くのです。 そこで、ゲノム解析にて滋賀県民に渡来人のゲノムが多いと言う点に、大いに興味関心が湧くのです。 絵：いらすとや 伊邪那美命と伊弉諾尊がはじめに生み出した島は「あわ」ですよね。 五十音で初めが「あ」、終わりが「わ」で、隣の国が「いよ」って話大好き…

植物の超階層生物学: ゲノミクス×フェノミクス×生態学でひもとく多様性 (種生物学研究 43号)文一総合出版Amazon 本書は種生物学会による種生物シリーズの最新刊．最近の同シリーズのテーマは共進化と行動生態学ということで進化生態学が軸になっていたが，今回はゲノミクスとフェノミクス（ゲノムと環境の相互作用により実現された発現形質のセットを分析するもの）をつないで植物の戦略を超階層的に捉えることがテーマということで，かなり至近的なメカニズムにも踏み込み，視野を広げてくれる一冊になっている． 構成的には第1部がゲノミクス編，第2部がフェノミクス編，第3部が（研究者のための）ノウハウ編となっている…

私のからだの中の、すべての細胞（６０兆個～４３兆個）には どれにも核があって、核の中にはDNAが収められていて、すべての 細胞のDNAが同じなのです。 ちょっと考えてみてください。 細胞の数×0.002ミリとはいったいどれほどのものか。 それらに同じDNAが備わっていることが不思議でもありますね。 DNAは染色体という形で核の中に存在する。ヒトの細胞では２３本の 染色体を必ず対になるように二本セット、合計４６本持っていますが、 これを「二倍体」と言います。 一個の卵子と１個の精子は半人前で、それぞれ１セット（２３本ずつ）しか 持たないが、受精することで、一対の染色体を備えた細胞になれる。 DN…

ja.wikipedia.org 「我々はどこから来たのか」「楽園のようなもの」「野菜のように(生きたい)」芸術家のおしゃれ格言でごきげんようおとなのみなさん。 ーーおとなのみなさんヤる事ありますよね? とかかんがえたりします。まあそんなにだいそれた事ではないのですが では ジブリで「もののけ姫」「コクリコ坂から」の2作品はとくに好きなのですが、前者はアシタカかっこいいからとサンかわいいからとかで後者はまあ青春の疑似体験的ななにかを得られたきがしたりするからです笑(こじらせるとこういうコンテンツの需要に合致します) もののけ姫の舞台は室町時代のニホンと言われており、場所はエミシからシシ神の森を…

世界のRNA分析市場は、収益ベースで2023年に53億ドル規模と推定され、2023年から2028年までの年平均成長率は13.4%で、2028年には99億ドルに達する見通しです。この調査レポートは、市場の業界動向分析から構成されています。この新しい調査研究は、業界動向、価格分析、特許分析、会議・ウェビナー資料、主要関係者、市場における購買行動で構成されています。研究開発活動の増加、創薬研究に対する政府資金の増加、製薬・バイオ産業の成長など、様々な要素がこの市場の主要な成長要因です。多くのペプチドベースの研究プロジェクトも、さまざまな企業間の共同パートナーシップの増加によって促進されており、これ…