ヌクレオチド

原核生物および真核生物において、上流のオープンリーディングフレーム（uORF、いわゆるリーダーペプチドをコードすることが多い）は、下流のメインORF（mORF）の翻訳と転写を制御することができる。しかし、新規機能性uORFのアノテーションは、通常100コドン未満という短いサイズであるため、困難である。転写および翻訳レベルのNGS技術は、ゲノムワイドな機能性uORFの同定に利用できるが、ゲノムが解読された大多数の生物種では、このデータはまだ利用できない。同時に、ゲノムアセンブリの量が飛躍的に増加していることから、機能性ORFの予測において進化的保存性を利用する機会が与えられている。ここでは、ユー…

世界保健機構（WHO）は、5月5日、COVID-19に関する「世界の公衆衛生上の緊急事態」(the public health emergency of international concer, PHEIC) の宣言の終了を表明しました。国内では、5月8日、政府がこの感染症症の感染症法上での分類の扱いを5類に引き下げました。世界的には自然感染とワクチン接種による免疫で死亡者が激減していますが、もちろんパンデミックは終わったわけではありません。 この先、原因ウイルスであるSARS-CoV-2がどのようになっていくのか、注目されるところですが、先月ネイチャー系雑誌にこのウイルスの進化に関する総説…

ファイザーは危険な成分を自社のワクチンに意図的に含めていた ファイザーのCOVID-19ワクチンには、「切断されたmRNA」と呼ばれるmRNA断片が含まれています。これは、ワクチンの生命に関わる安全性の問題に加えて、深刻な問題です。驚くべきことに、ファイザーは、偽造されたmRNA分析レポートを複数の保健当局に提出しました。 切断されたmRNAの問題は、ヨーロッパ医薬品庁（EMA）が2020年12月のワクチンの条件付き承認前に「大きな異議」を提起する原因となりました。何が起こったのか？これらの問題はどのように解決されたと考えられているのか？この2部構成の記事では、この問題を深く掘り下げ、人間の健…

今年の夏休みは楽しみがいっぱいだ～！それまで頑張る！ p103 p104 p103 fled the pogroms ※fled 逃げた（fleeの過去・過去分詞形） pogrom 19世紀後半から20世紀初頭にかけて、ロシアを中心に行われたユダヤ人の虐殺のこと glamorous グラマラス Alto Leblon, a ritzy suburb south of Rio ※ritzy 豪華な The Ritz-Carlton（リッツカールトンホテル）のritzから作られた形容詞 Isabel and Nate: like two peas in a pod ※pea 豆 beanとの違い …

非コードRNAは転写プロセスにおいて重要な役割を果たし、様々な生物学的機能の制御に関与している。特にmiRNAやlncRNAが重要である。しかし、既存のシグナル伝達パスウェイデータベースには、miRNAやlncRNAに関する情報は含まれていない。そこで本著者らは、222のKEGGパスウェイ（27のサブカテゴリーを含む）において、178 308のヒト実験的に検証されたmiRNA-ターゲット相互作用（MTI）、32 282のlncRNA-ターゲット相互作用（LTI）、4837実験的に検証されたヒトceRNAネットワークを統合・可視化して、NcPathという新しいパスウェイデータベースを設計しなおし…

特殊な機能をコードする遺伝子の共局在は、微生物ゲノムに共通し、より大きな真核生物のゲノムにも存在する。重要な例として、薬用、農業用、工業用として価値のある特殊な代謝物（例：antimicrobials）を生産する生合成遺伝子クラスター（BGC）がある。BGCの比較解析は、公開ゲノムにおける分布やバリアントを明らかにすることで、新規代謝物の発見を支援する。しかし、遺伝子クラスタレベルの相同性検出は、アクセスしにくく、時間がかかり、解釈も困難である。 比較遺伝子クラスター解析ツールボックス（CAGECAT）は、全遺伝子クラスターの比較解析における困難を軽減するための迅速で使いやすいプラットフォーム…

未来に可能性を感じない日本 100歳以上長生きしたいと思わない人が7割～8割もいるということで以下の記事を書いた。 seege.hatenablog.com 今の時代、給料は上がらず、税金だけが上がっていく。 それでも、若い頃に死に物狂いで頑張って子供を大学に入れて、何とか卒業を迎え、就職も決まり、親としての務めを果たしたと思っていると、会社からは、割増の退職金をチラつかされて、早期退職を促される。 まとまった金が今、入れば家のローンは返せるが、年金が支給されるのは、まだまだ先。 しかも年金が支給される年齢は遅くなる傾向にあり、支給額も減らされ傾向にある。 その上、70歳まで働けと言われる。 …

" The Inflammasome NLRP3 as a novel therapeutic target for Idiopathic Pulmonary Fibrosis (IPF) RMLC Biancatelli, P Solopov, JD Catravas - The American Journal of …, 2022 - Elsevier … of IL-1 cytokines are chronically overexpressed in patients with COPD, asthma and IPF [42, …of collagen when treated …