NCBI SRAでは公開されているシークエンシングデータを検索し、必要であればダウンロードできる。 metagenomeと検索してみると4,566,384件ヒットした(2024年4月実行)。 metagenomeと検索したが、16Sがタイトルに含まれるシークエンシングデータがトップヒットしている。meta16Sはメタゲノムでないが、metagenomeの定義が曖昧であるために、このように関係ないデータがヒットする事がある。 このような時はNOTで絞り込む。”metagenome NOT 16S”と検索したところ、2,656,920ヒットに減ったが、今度はampliconがトップヒットしている。…