GENET

クロノタイプとは？ クロノタイプの年齢ごとの変化 環境によって変化するクロノタイプ それぞれのタイプの起床・睡眠時間帯 クロノタイプ診断テスト 参考論文 クロノタイプとは？ クロノタイプとは、24時間のうち特定の時間に私たちが眠る傾向があることを意味しています。 極端に分けると、「睡眠時間が遅い夜型」と「睡眠時間が早い朝型」の2つに分けられます。 ほとんどの人は睡眠時間のタイミングには、ある程度の柔軟性を持っていて、自分の意思で朝早く起きることも夜遅くまで起きていることもできます。

AZF欠失と男性不妊 知り合いの先生から相談があったので調べてみました。 ヒトの場合、44本は常染色体と男女の性別を決定づける2本の性染色体を持っています。女性は46XX、男性は46XYと表現されます。 この男性が持っているY染色体の中に、無精子症因子(Azoopermia factor：AZF)というものがあります。 このAZF因子の構造に問題があると、男性不妊となります。 ・AZFc AZFにはAZFa、AZFb、AZFcの三つの領域があり、この領域の遺伝子配列に問題がると精子が正常に作られません。 AZFa、AZFb領域の異常の場合は無精子症となることが分かっており、精巣内精子回収術を行…

出たばっかりほやほやのCHIPの論文です。インドのものです。 IFは高くない雑誌ではありますが注目を集めている分野なので取り上げてみます。 Senguttuvan NB, Subramanian V, Venkatesan V, Muralidharan TR, Sankaranarayanan K. Clonal hematopoiesis of indeterminate potential (CHIP) and cardiovascular diseases-an updated systematic review. J Genet Eng Biotechnol. 2021 Jul 19…

イベルメクチン（ivermectin）に関するご質問にパレオ協会のQ&Aにも回答しましたが、ハイドロキシクロロキン（HCQ）と同じく、陰謀説が流布しています。。。。 これにもそろそろ明確な回答をしなければなりません。 イベルメクチンは当初は抗ウイルス効果の高いグリシンと同じメカニズムで作用すると考えられていました（Ivermectin, an unconventional agonist of the glycine receptor chloride channel.J Biol Chem. 2001 Apr 20;276(16):12556-64.）（Molecular determina…

哺乳類の特徴といえば、体中が毛に覆われているとか子を乳汁で育ているとかいくつかありますが、中でもわかりやすい特徴に「胎生である（赤ちゃんを体の中で育てる）」と挙げる人は多いでしょう。胎児が発育するためには胎盤という母体と胎児をつなげる器官が必要ですが、この胎盤を形成するのためにウイルスの遺伝子が関わっていた、という報告が20年近く前から出されるようになりました。 さて、胎盤は哺乳類の種類によってバリエーションに富んだ器官です。ヒトを含めた真獣類では漿尿膜胎盤と呼ばれる構造をしているのですが、カモノハシやハリモグラなどの単孔類やカンガルーなどの有袋類は卵黄嚢胎盤という構造をとっています。これは、…

ゲノム構造の複雑さとそのユニークな構造を理解することは、これらの特徴を表現するために使用される視覚化ツールの能力と関連している。このようなツールは、ゲノムコンテンツの現実的でスケーラブルなバージョンを提供することができなければならない。ここでは、プラスチドに焦点を当てたオンラインオルガネラプロットツールを紹介する。このツールは、葉緑体ゲノムの排他的な構造を可視化するために開発された。このプログラムの特徴は、Single Short Copy（SSC）領域を逆相補的に表現することで、各遺伝子のコドン使用量の偏りを表現できること、逆反復（IR）領域間の小さなミスマッチを表現できること、そしてユーザ…

はじめに いま世界中でCOVID-19用のワクチンが拡大しつつあり、日本でも急速に接種が進められています。この中でもmRNAワクチンが優先的に用いられており、ファイザー製とモデルナ製がその中心です。メディア報道では、パンデミック終息への切り札（game changer）になると期待されています。 一方で、mRNAワクチンは、ワープスピード作戦という前例のない短縮治験を経て緊急使用許可（emergency use administration）されたワクチンであり、mRNAの人体導入という人類初の試みであることも忘れてはいけません。だからこそ、未知の負の影響があるかもしれないということも想像され…

はじめに 今日の進化論のパラダイムをなすのは、およそ90年前に成立した進化の「現代総合説」（Modern Synthesis）である。現代総合説ではラマルク流の主張である「獲得形質の遺伝」は強く否定された。その否定の仕方は尋常ではなく、獲得形質の遺伝だけでなく、「獲得形質」という言葉までもが禁句（タブー）とされ、論文や生物学の教科書などではいっさい使われない時代が続いた。そのようなタブーの裏には、生物学界史上最大のスキャンダルといわれた事件 [1] が、ちょうど同じ時期に起きたことが大きな要因だったと思われる。 ところが、今世紀になって生物学の革新的な研究分野であるエピジェネティクスの登場とと…

(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); R言語を使った、RNA-seq解析チュートリアルを作成してみた。 データは、RNA-seqのカウント済みのデータを使用している。 本記事は、以下のArticleの日本語訳記事 + α である。 # HGEN 473 - Genomics # Spring 2017 # Tuesday, May 9 & Thursday, May 11 # RNA-seq analysis with R/Bioconductor # John Blischak # Last updated: 2020-04-0…

Raspberry Pi 4の有線LANのインターフェースのドライバに一行加えてパケットを送信するためにログ出力するように改造してみたメモ。 NICはどうやら Broadcom 2711 というSoCに付いているもの？のようで参考リンクに記載がある。 手順 一行追加 以下に一行追加 drivers/net/ethernet/broadcom/genet/bcmgenet.c linux/bcmgenet.c at 96110e96f1a82e236afb9a248258f1ef917766e9 · raspberrypi/linux · GitHub int i; pr_info("====b…

遺伝子変異の病原性を分類するための標準化ガイドライン「ACMGガイドライン」を紹介します。