Grüezi, タンパクの結晶構造を見てる時に,ふと特定のアミノ酸が何処にあるかとか,それが全部で何個あるか気になることってありますよね. 例えばLysineが何個あるか数えたい時は,PyMOL上のコマンドラインで,こう唱えます. count_atom resn lys and chain A and backbone and elem n count_atom (selection)でselectionの原子数を数えられます. これを利用して,LysineかつChain Aかつ主鎖かつN原子の数を数えればタンパクに含まれるLysineの数を数えられるはずです. コマンドを打つのが面倒なので,…