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(コンピュータ)
【あーるこう゛】

ruby のコードカヴァレッジツール。速度が速く、rake や rant, rails などにも対応している。

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macでインフォマティクス•2ヶ月前

大規模なゲノム配列セットのANI値を計算する LZ-ANI

LZ-ANIは、大規模なゲノム配列セットの平均ヌクレオチド同一性（ANI）を決定するための、高速でメモリ効率のよいツールである。このツールはLempel-Ziv構文解析を使用し、一致するヌクレオチドと不一致のヌクレオチドを高感度で識別し、ANIの正確な決定を可能にする。LZ-ANIの効率性は、簡素化されたインデルの処理モデルに由来し、最も高感度なBLASTn検索に匹敵する精度を維持しながら、アライメントベースのツール（BLASTn、MegaBLASTなど）よりもはるかに高速である。 LZ-ANIは、ウイルスゲノムの比較およびクラスタリングツールであるVclustの主要コンポーネントになっている…

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