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研究開発創作日誌 このページをアンテナに追加 RSSフィード

2011-09-05

第4章 「1.解析プラットフォーム紹介【中尾光輝/藤澤貴智】」実験医学増刊 Vol.29 No.15「使えるデータベース・ウェブツール」

有田正規さん編纂による実験医学増刊号「使えるデータベース・ウェブツール」に、DDBJ の藤澤さんといっしょに記事を執筆しました。解析プラットフォーム GalaxyやBioMart、Cytoscape活用の解説です。

Galaxyの説明のところでは、いわゆる Galaxy彼女ができた、という都市伝説が、いつのまにか原稿から消えていました。文字数の都合とかそういう、そういうものです。

2011-08-02 DBCLS BioHackathon 2009

The 2nd DBCLS BioHackathon: interoperable bioinformatics Web services for integrated applications, Journal of Biomedical Semantics 2011, 2:4

バイオハッカソン2009の活動報告としてのレビュー論文出版されました。


Review

The 2nd DBCLS BioHackathon: interoperable bioinformatics Web services for integrated applications

Toshiaki Katayama*, Mark D Wilkinson, Rutger Vos, Takeshi Kawashima, Shuichi Kawashima, Mitsuteru Nakao, Yasunori Yamamoto, Hong-Woo Chun, Atsuko Yamaguchi, Shin Kawano, Jan Aerts, Kiyoko F Aoki-Kinoshita, Kazuharu Arakawa, Bruno Aranda, Raoul JP Bonnal, José M Fernández, Takatomo Fujisawa, Paul MK Gordon, Naohisa Goto, Syed Haider, Todd Harris, Takashi Hatakeyama, Isaac Ho, Masumi Itoh, Arek Kasprzyk, Nobuhiro Kido, Young-Joo Kim, Akira R Kinjo, Fumikazu Konishi, Yulia Kovarskaya, Greg von Kuster, Alberto Labarga, Vachiranee Limviphuvadh, Luke McCarthy, Yasukazu Nakamura, Yunsun Nam, Kozo Nishida, Kunihiro Nishimura, Tatsuya Nishizawa, Soichi Ogishima, Tom Oinn, Shinobu Okamoto, Shujiro Okuda, Keiichiro Ono, Kazuki Oshita, Keun-Joon Park, Nicholas Putnam, Martin Senger, Jessica Severin, Yasumasa Shigemoto, Hideaki Sugawara, James Taylor, Oswaldo Trelles, Chisato Yamasaki, Riu Yamashita, Noriyuki Satoh and Toshihisa Takagi

Journal of Biomedical Semantics 2011, 2:4 doi:10.1186/2041-1480-2-4


2011-06-16

The Power of Open 日本語版

http://thepowerofopen.org/assets/images/cover.jpg

クリエイティブ・コモンズ・ライセンスの活用事例集 The Power of Open翻訳に参加しました。


この本は、いろいろなクリエイティブ現場創造物のライセンスクリエイティブ・コモンズ・ライセンスをつかって成功している事例紹介です。どんな分野でつかわれているの? つかうことで何が得られたの? トレードオフは? という疑問に答えられる内容となっています。

印刷版PDFでは、CC-BY ライセンス写真を実際に再利用し、冊子自体が Reuse 事例になっているところがひそかに注目するところでしょうか。

翻訳版PDFダウンロードサイトから取得できます。

2011-03-31

2011-02-28 JSBi 第1回 応用システムバイオロジー研究会

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