ggplot2

はじめに 調べても分からなかったので自分なりにやってみる黒魔術シリーズです。もっといい方法があれば教えてください。 この記事では、ggplot2パッケージを利用してバイナリツリーのグラフを作成します。 【他の内容】 www.anarchive-beta.com 【目次】 はじめに ggplot2で二分木を作図したい 二分木の作成 部分木インデックスの計算 部分木の作成 欠損の作成 参考文献 おわりに ggplot2で二分木を作図したい ggplot2パッケージを利用して、二分木(二進木・バイナリーツリー・binary tree)のグラフを作成する。 利用するパッケージを読み込む。 # 利用パッ…

前回の記事の補足です。X（旧Twitter）でこんなコメントをいただきました。沖縄がキツいのは湿度と日差しの強さなので、そういう比較のグラフも見てみたいけど。夏の気温だけでいうと埼玉や新潟の方が高いのは実感としてある。 https://t.co/1Zg9Q2mzOo— ◤◢NK Apple User ◤◢ (@n_kuramoto) 2023年8月27日 平均湿度のデータなら前回取得しているのでちょっとグラフにしてみましょう。 ただ、湿度のデータは1960年以降しかありません。まず、前回のデータを呼び出してざっと整形します。 library(conflicted) library(tidyve…

2023年の8月もそろそろ終わります。 しかし、まだまだ暑くて秋の気配はまだまだ来ないようです。さてここ数年、7月に入ったころから「昔はこんなに暑くなかった」「いや、そんなことはない」といった話題がSNSをにぎわせています。 私も数年前にこんなグラフを作って、周りではそこそこ評判良かったです。東京の8月の最低気温の分布の推移。いまさらだけど、ちゃんと書き直したのもあげておく。最低気温の上限が90年代以降上昇しているという結論は変わらないけど。boxplotもおまけで付けておいた。 pic.twitter.com/wfxgfr7I3O— ボブさん (@bob3bob3) 2018年7月18日 今…

はじめに とりあえず我流でやってみる黒魔術シリーズです。もっといい方法があれば教えてください。 この記事では、カレンダーを作成します。Rでカレンダーを作るのであれば(私はよく知りませんが)calendRパッケージを調べてみるのがいいと思います。 【他の内容】 www.anarchive-beta.com 【目次】 はじめに ggplot2でカレンダーを作成したい インデックスの確認 ひと月のカレンダー 基本形 装飾 利用例 ひと年のカレンダー 基本形 装飾 利用例 任意の期間のカレンダー 基本形 装飾 利用例 参考 おわりに ggplot2でカレンダーを作成したい ggplot2パッケージを利…

はじめに 関連パッケージ BTCの月足データの平均足チャートを作成する 月足データのストキャスティクスRSIオシレーター BTCの週足データの平均足チャートを作成する BTCの日足データの平均足チャートを作成する dygraphsで複数のローソクチャートを描く まとめ 補足 月足データにケルトナー・チャンネルを重ねてみると、、 Rコード 参考資料 はじめに 平均足(Heikin-Ashi)とは、通常「1日分」のデータを使ってローソクチャートを作成するところを、その倍の「2日分」のデータを用いて作成するローソクチャートのことを言います。 そのため、細かなノイズが省かれて、トレンドの流れを視覚的に…

Qiita に書きました。 qiita.com

「ggplot2によるデータの視覚化」 第二弾はジェット戦闘機編ggolot2でくらべる飛行機－ジェット戦闘機編 ggplot2によるデータの視覚化作者:山岡直樹Amazon子供の頃から、何かしら自分の作品を出して LEVIN と TRUENO と名付けたかったんだけど、 今回使ったグラフ描画時の theme に無理矢理 LEVIN と TRUENO と名付けてみた。こっちが theme_trueno (雷鳴) で こっちが theme_levin (稲妻) 本の目次はじめに 1. ggplot2 による散布図の描画 1.1. 単純な散布図 1.2. 国ごとに色を変える 1.3. グラフのタイ…

はじめに 素直なやり方ではできなかったのでむりくりなんとかする黒魔術シリーズです。もっといい方法があれば教えてください。 この記事は、「R言語 - Qiita Advent Calendar 2024 - Qiita」の7日目の記事です。 この記事では、R言語でグラフを作成する際に少し複雑な数式を表示する方法を解説します。 【目次】 はじめに expression関数で微妙に凝った数式を表示したい expression記法 有効数字 プラスマイナス 絶対値 ノルム 変数を並べる 等式を並べる 条件付き分布 改行 参考文献 おわりに expression関数で微妙に凝った数式を表示したい bas…

PythonのPolarsでRのgroup_nestを実現する Polarsでgroup_nestがしたい R or Python 僕がRで分析するときはいつもこちらの記事を参考にしています。 https://qiita.com/kilometer/items/7184904765fbf0f33f04 tidyverseでデータを読み込んだ後は、なんらかの変数でグループ化して、ネストして、各データセットに対してmapを通じて処理をかけていくと。Rはスクリプト言語でありベクトル化された処理に最適化されているので、大容量のデータを扱う場合はこちらの方が速いですし、何より読みやすいです。 Rはユーザ…

ドーモ、無職です。 「さいきん何やってるの？」という質問に対して、端的に答えるにはちょっとマニアックすぎることをやっていて説明に困ることが多く、ちょっと整理も兼ねてブログを書きます。 vellogd という R のグラフィックデバイスをつくっています。

R言語は、統計解析やデータ可視化、データ科学に特化したプログラミング言語です。 CRAN（Comprehensive R Archive Network）には、統計解析や機械学習、データ処理、可視化などのための数千のパッケージがあります。ggplot2などのパッケージを使って、複雑なデータの視覚化が容易に行えます。Rは、線形回帰、一般化線形モデル、時系列解析、クラスター分析など、さまざまな統計手法を実装しています。Rはオープンソースソフトウェアであり、無料で利用できます。RStudioなどの統合開発環境（IDE）を使うことで、コードの実行やデバッグがしやすくなります。 ＞#パッケージのインスト…

グラフの中に込めるストーリー 〜 ggplot2とfacet_gridでデータを語らせる魔法 データの世界は、ただの数字や記号の羅列に見えるかもしれません。けれど、私たちがその背後にある物語を紡ぎ、視覚化することで、データは命を吹き返すのです。今日は、R言語のggplot2を使って、データに意味を与える方法を一緒に学んでみましょう。そのためのツールは、facet_gridとgeom_text。これを駆使することで、データが語るストーリーをグラフに表現するのです。 facet_gridとgeom_textの魔法 まずは、どんな物語を作るのかをイメージしてみてください。例えば、さまざまな都市の温度…

Rのパッケージreadr 2.1.5のリファレンス和訳です。readrはHadley Wickham氏の作成したtidyverseの一部で、CSV等の長方形データセットを読み込む機能を提供します。 原文はMITライセンスですが、原文の権利はHadley Wickham氏と貢献者方にあります。翻訳文の使用は自己責任です。 readrパッケージ - tidyverse.org readrパッケージ - GitHub readr 概要 インストール 使い方 エディション 代替手段 Base R data.tableとfread() 謝辞 readr 概要 readrの目的はCSV (カンマ区切り値)…

役に立たないネタだが、役に立たないが役に立つパッケージがあるという話（最近何も書いてないのでR関連小ネタ）。 役に立たないということで役に立つパッケージ、{ThreeWiseMonkeys}がある。 この{ThreeWiseMonkeys}はCRANからダウンロード・インストールされることを意図していないパッケージ（ダウンロード・インストール自体はできる）で、パッケージに含まれる関数も特に有用といえるものではない。 CRAN: Package ThreeWiseMonkeys ではどのように役に立つのかというと、RStudioのCRANミラーはパッケージのダウンロード数が確認できるAPIが公開…

だいぶ久しぶりの記事です。前回記事から、MBA合格・渡米・入学・就職といろいろありました。 RでもNerural Networkがしたい！ 論文でNeural Networkでモデルの推定をするにあたり、Torchを使いたい。しかし、PyTorchは（当然ながら）Pythonしか対応していません。授業の課題で書いたコードも全部Python。授業のコードを見ると、Pythonだと変数が多くてコードが読みにくいんですよね。 しかしなんと、最近はRでもtorchが使えるらしいじゃないですか 英語では結構文献があります。パッケージのオフィシャルサイトとCRANへのリンクを貼っておきます。 CRAN O…

2024/09/29 修正 パンゲノム解析は、細菌集団で起こる分子進化を探るための基本的な手法である。ここでは、パンゲノムデータを簡単に扱うことができるRフレームワークPagooを紹介する。Pagooはカプセル化されているため、複雑な分子情報や表現型情報をオブジェクト指向のアプローチで保存することができる。これにより、1つのプログラミング環境を用いてデータを遡ったり戻したりすることが容易になり、解析のどの段階でも（生データを含めて）1つのファイルに保存することができるため、共有可能で再現性のあるものとなる。Pagooは、Rエコシステムで利用可能な他の微生物ゲノム解析パッケージと連携して、クエリ…

ちょっと前にでかめの機能追加がマージされたので、それの解説をします。と言っても、まだ機能が全部出揃ってるわけではないし（関連する主な pull request は 3 つあって、まだ 1 つ目がマージされただけ）、正式なリリースもいつになるか分からないので、プレビュー版みたいなものだと思って読んでください。

はじめに カプランマイヤー曲線を少しだけ変更してみる。 とりあえず描くためのコード 方法1 ggsurvplotの引数を変更する。 線の色を変える 軸ラベルを変更する。 テーマを変更する。 凡例の名前を変更する。 方法2 ggplot2の関数を使って変更する。 生存期間関連の表も綺麗に出してみる。 まとめ はじめに 以前の記事で、カプランマイヤーを描いてみました。 med-ruka.hatenablog.com その後使うにつれて、もう少し綺麗に描きたいと思いました。 そこで今回はもう少し綺麗に描くための細かい技をまとめておきます。 library(survival) library(surv…

・お題：ggplot2でプレートのヒートマップを作りたい。 # ライブラリ読み込み library(tidyverse) # ggplot2を含むパッケージ集library(ggsci) # カラーパレットのパッケージ library(magrittr) # パイプなど使いやすくする # データフレーム作成 df_96well <- matrix(0:95, nrow = 8, ncol = 12) %>% as.data.frame() %>% set_rownames(LETTERS[1:8]) df_96well # オブジェクト作成 p <- df_96well %>% mutate(…