長崎県の五島列島に位置する郡。明治時代に肥前国松浦郡を分割し、五島列島の部分を南松浦郡、九州本土北松浦半島の部分を北松浦郡としたことに始まる。 平成の市町村大合併により、2004年8月1日下五島地区の富江町、玉之浦町、三井楽町、岐宿町、奈留町は福江市と対等合併し五島市に、上五島地区の新魚目町、上五島町、有川町、奈良尾町、若松町は5町で対等合併し新上五島町となった。これにより、南松浦郡は新上五島町の1町のみとなった。