nanoプロジェクト

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  昨日の校正を仕上げる。
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    朝 alex の部屋に寄って、彼のあげた修正を一通り聞く。 で、それをまとめてボスにメールして、終わり。
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    手元の latex 原稿も改訂しておく。 slip.tex: 2.5 2008/07/29 19:31:54 ichiki Exp
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  7/29/2008:
  ちょうどいいタイミングなので、ちょっと休暇をとることにする。
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  論文の経過：
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    9/2/2008: published.
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    7/29/2008: 校正、済み。
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    7/28/2008: ゲラが届く。
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    10/9/2007: accepted.
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    9/6/2007: submitted.

ryuon

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  高速な implicit algorithm の実装、 phase 2 - top level への組み込み：
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    現状を整理。 Brownian dynamics 関連の parameters は、 "BD-scheme" で integrator を、 "BD-nl-solver" で implicit scheme の solver を指定している。
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    なので、 BD-scheme に "SI-connector" を、 BD-nl-solver に "fastSI" を追加することにしよう。
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    コードにどう手を入れていくか、見ていく。
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      今回書いた新しいコードは struct BD_imp を受けて動くようになっているので、 問題無し（というか、ここしばらくは、この一般化に時間を費やしていた、と）。
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      evolver として bd-imp.c の BD_imp_ode_evolve から fastSI 系のコードを呼べばよい。
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      そのルーチン（wrapper, 名前は BD_evolve_fastSI かな） を書けばよい、と。
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    今日はここまで。
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    8/11/2008: 実装、完了。もうちょっと。

セミナー。

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  系を環境とターゲットに分けるとき、という話。
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  そういえば、私の恩師もある意味似たような話をしていたような気がする。 私はそっち方面に進まなかったので、分かっていないけれど。
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  今回の話は、量子効果（いわゆる化学的な影響）を古典論のスケールに使うような話。 いわゆる QM/MM の、 multiscale simulation の話。 かなり堅実な路線で攻めていらっしゃる、という印象 （まったくの素人の目からみた、だけど）。

不意の、日本からの訪問者。

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  社会人の方。一念発起されて修士から留学される予定、とのこと （うちのグループに、ではない）。 お若いのに、いろいろと自覚的に、主体的に動いていらっしゃるのを見て、 無自覚に、受動的に流されている年より（である私）は、ただただ、すごいな、と感じた。 こういう人のお嫁さんになれば、苦労しないだろうね。（すみません。）

今日もきちんと散歩に連れていく。

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  また、ジョギングの代わり、とする。４０分くらいかな walking で。

突然だけど、急遽、明日から休暇をとることにする。

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  ちょうどゲラもあげたことだし、時間をとるなら今しかないかな、と。
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  と言っても、モンがいるし、別に遠出をするつもりはない。純粋な休暇の予定。
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  そうそう、例の論文でも仕上げるか（って、それじゃあ休暇じゃないか）。
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    7/31/2008: 休暇中に本当にやる気になった。
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  7/31/2008: モンちゃん病院に。
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  8/6/2008: 休暇、終了。