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【初心者向け】基礎＆実践プログラミング•24 日前

【脳MRI画像解析】ComBatをもちいたデータの調和（Harmonization）

動かしながら学ぶ PyTorchプログラミング入門作者:斎藤勇哉発売日: 2020/11/30メディア: Kindle版 目的 背景 準備 使用するデータ data.csv ソースコード Result 目的 多施設MRIデータに含まれる施設間差（MRI装置・撮像条件）の評価 ComBatを用いて施設間差を除去（データの調和） 施設間差補正後の評価 拡散定量値を用いて、施設間差を評価 背景 多施設で取得されたMRIデータは、施設ごとに異なる撮像装置および撮像条件で取得されたものであり、施設間差（site effect）を含む。そのため、この施設間差と本来観測したい個人間の差（ex. 疾患・成長・…

#Python#DeepLearning#MachineLearning#Ubuntu#MRI#DICOM

ネットで話題

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30ブックマークAMA Geoffrey Hinton : MachineLearningwww.reddit.com
18ブックマーク[Project] All Code Implementations for NIPS 2016 papers : MachineLearningwww.reddit.com
13ブックマークMicrosoft PowerPoint - Canon-MachineLearning27-jp.pptxCanon ２０１２年９月１３日 トピックモデル概論 東京工業大学 計算工学専攻 杉山 将 sugi@cs.titech.ac.jp http://sugiyama-www.cs.titech.ac.jp/~sugi/ 概要 文書のモデル化は，自然言語処理や 機械学習の分野で盛んに研究されて いる 本講義では，文書のモデル化技術の 発展の経緯を概観する 2 講義の流れ 1. 2. 3. 4...sugiyama-www.cs.titech.ac.jp
9ブックマークAMA: We are the Google Brain team. We'd love to answer your questions about machine learning. : MachineLearningwww.reddit.com
9ブックマークmachine_learning_security/Security_and_MachineLearning at master · 13o-bbr-bbq/machine_learning_security · GitHubgithub.com
8ブックマークBayesian Optimization for Python : MachineLearningwww.reddit.com
8ブックマークMicrosoft PowerPoint - Canon-MachineLearning22-jpCanon ２０１１年８月３日 クラスタリング（２） 東京工業大学 計算工学専攻 杉山 将 sugi@cs.titech.ac.jp http://sugiyama-www.cs.titech.ac.jp/~sugi/ 概要 前回の講義では，確率モデルに基づくクラスタ リング手法を紹介した これらの手法では，各クラスのパラメトリック モデルをあらかじめ指定しなければならない ...sugiyama-www.cs.titech.ac.jp
8ブックマーク[D] Google Translate "happy to see hong kong become China" : MachineLearningwww.reddit.com
8ブックマークTips on publishing in NIPS, ICML or any top tier conferences for ML : MachineLearningwww.reddit.com

関連ブログ

【初心者向け】基礎＆実践プログラミング•先月

【Python】ROC曲線の作成・AUC算出・最適なカットオフ値の決定・分類正確度 / 感度 / 特異度の算出まで

動かしながら学ぶ PyTorchプログラミング入門作者:斎藤勇哉発売日: 2020/11/30メディア: Kindle版 目次 目次 目的 重要な関数 準備 コード 結果 ROC曲線 分類精度 混合行列（Confusion matrix） 目的 Pythonを使ってROC曲線を作成 Youden indexを用いて、最適なcutoff値を決定 AUCおよび分類正確度・感度・特異度を算出 重要な関数 ROC曲線の作成：roc_curve AUCの計算：roc_auc_score 正確度の計算：accuracy_score 以上の関数は、scikit-learnのライブラリである。インストールして…

#MRI#Python#DeepLearning#Ubuntu#MachineLearning
【初心者向け】基礎＆実践プログラミング•先月

【脳MRI画像解析ケーススタディ】施設間差の評価　～拡散定量値の観点から～

動かしながら学ぶ PyTorchプログラミング入門作者:斎藤勇哉発売日: 2020/11/30メディア: Kindle版 目次 目次 目的 背景 準備 解析手法 1. JHU atlasをSiteAデータに位置合わせ 準備 ソースコード 結果 2. 絶対差マップの生成とJHU atlasを用いたサンプリング 準備 ソースコード 結果 3. 脳領域ごとに絶対差を図示 準備 ソースコード 結果 目的 多施設MRIデータに含まれる施設間差（MRI装置・撮像条件）の評価 施設間差補正後の評価 拡散定量値を用いて、施設間差を評価 背景 多施設で取得されたMRIデータは、施設ごとに異なる撮像装置および撮像…

#Ubuntu#Python#MRI#Deep learning#MachineLearning
【初心者向け】基礎＆実践プログラミング•先月

【Python】DICOMのソート処理

動かしながら学ぶ PyTorchプログラミング入門作者:斎藤勇哉発売日: 2020/11/30メディア: Kindle版 目次 目次 目的 準備 ソースコード dcm2niiバージョン dcm2niixバージョン 使い方 目的 様々なSeriesDescriptionで撮像されたDICOMデータを、SeriesDescriptionごとにフォルダ分け DICOMをNIfTI変換 Pythonで実行 準備 PythonでDICOMを扱うために、pydicomを用いる。 pip3 install pydicom ソースコード 実際に、DICOMをNIfTIに変換するソフトは、Chris Rorde…

#DICOM#MRI#Python#Ubuntu#Deep learning#MachineLearning
【初心者向け】基礎＆実践プログラミング•2 か月前

【Slack API】自動いいね・ダイレクトメッセージ・投稿収集

動かしながら学ぶ PyTorchプログラミング入門作者:斎藤勇哉発売日: 2020/11/30メディア: Kindle版 目的 準備 アクセストークンの取得 SlackチャンネルIDの確認 Slackのあるチャネル内の投稿に、自動いいね 使用するAPI コード 使用するAPI コード Slackから投稿コメントを一括収集 使用するAPI コード 結果 目的 Slackのあるチャネル内の投稿に、自動いいね Slackで自動ダイレクトメッセージ Slackから投稿コメントを一括収集 準備 アクセストークンの取得 Slack APIを使用するためには、アクセストークンが必要である。次の手順で、アクセ…

#slackbot#Slack#Python#Ubuntu#Deep learning#MachineLearning
sai10の雑記•2 か月前

HoloLens2でWindows.AI.MachineLearningを使って手の動作認識を行う

はじめに 昨年7月にHoloLensMeetupで発表した手の動作認識では、機械学習のライブラリとしてOpenCVForUnityを用いていました。 画像処理の機能が使える反面、OpenCVForuUnityを使用する場合だとライセンス料がかかってしまう、という欠点があります。 そこで、HoloLens2でWindows.AI.MachineLearningを使って手の動作認識をしてみました。 UWP標準の機能を用いることで、特別にライセンス料などのコストをかけることがなく機械学習を用いることができます。 youtu.be コードはGithubに上げてあります。 ポイントをいくつか挙げて解説し…

#機械学習#Hololens2#MachineLearning#ONNX#動作認識
週間クラウドニュース•先月

2021年2月25日(木)のツイート履歴

ツイート Kimihiko Kitase [emoji:4B0] @kkitase はじまりましたー。 合同会社EXNOA（旧 DMM GAMES）、BASE株式会社 に登壇いただきます。お楽しみに。 #gc_digital https://twitter.com/googlecloud_jp/status/1362268590234247172 18:01 Kimihiko Kitase [emoji:4B0] @kkitase Gitlab も早速 Autopilot で https://twitter.com/sarki247/status/1364628750483161089 17:…

micro:bit情報•2 か月前

micro:bit新着情報(2021/02/12)

ちゃつみん（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/286159961/status/1359860553758330889 ツイート:ラズパイPico入手した。何に使うかまったく未定だけど。。 あとラズパイのキーボード(黒)とmicro:bit(v2)も https://t.co/5t96NYgtXn kenji（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/391454639/status/1359854807683526657 ツイート:micro:bitの波形を手元にあったポケットオシロDANIU DSO188で見てみた。 ドレミファの波形みたの初…

micro:bit情報•2 か月前

micro:bit新着情報(2021/02/10)

tomi rss（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/1559279730/status/1359210840478646282 ツイート:JavaScript - Qiita Web Serial API を使って micro:bit からセンサーの値（XYZ）を読み取る＆リアルタイムなグラフ化 https://t.co/lgNgJRkX58 you（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/62238122/status/1359210707376508928 ツイート:仕組みに関する記事も書けた！●Web Serial API を使って mi…

micro:bit情報•2 か月前

micro:bit新着情報(2021/02/09)

Microbit_greenhouse（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/1257480996305305600/status/1358803895011655682 ツイート:RT @KSY_RasPi_Shop: 本日からmicro:bitのアクセサリ類も取り扱いを開始いたしました 他にどういった商品があると嬉しいですか？ ぜひ参考にしたいのでリプで教えてください #microbit #マイクロビット Microbit_greenhouse（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/1257480996305305600/status/135…

labunix's blog•2 か月前

aws * waitサブコマンドについて調べてみる。

■aws * waitサブコマンドについて調べてみる。 イベントが完了されるまで待機する。 試行回数が一定回数を超えたら、リターンコード255を返してタイムアウトする。 $ awk '/wait/{print NF | "sort -uV"}' aws-allsubcmd.txt 3 $ awk '/wait/{print $2}' aws-allsubcmd.txt | wc -l 40 ■リターンコードは以下から。 $ awk '/^[0-9]*$/' return/code | grep -v "^\$" 0 1 2 130 252 253 254 255 ■検索するときは以下のように。…

labunix's blog•2 か月前

AWS CLIコマンドのすべてのパラメータファイルを「--generate-cli-skeleton 」で生成してみる。

■AWS CLIコマンドのすべてのパラメータファイルを「--generate-cli-skeleton 」で生成してみる。 まずは前回と同様に。 AWSのEC2イメージを調査して、最新のAMIイメージIDを取得してみた。 https://labunix.hateblo.jp/entry/20210206/1612545305 ■前回の最新のAMIイメージIDを取得するために、「--generate-cli-skelton」を指定する。 $ aws ec2 describe-images --generate-cli-skeleton > aws_ec2_describe-images.json…

sai10の雑記•2 か月前

sklearnで作成したRansomForestモデルをONNXに変換してwinML(UWP)で利用する

はじめに sklearnで作成したRansomForestモデルをONNXファイルに変換し、Windows Machine Learningで利用する際に気を付けることを書いていきます。 サンプルに、HoloLens2取得したHandGestureを分類するコードをGithubに挙げました。 github.com 環境(python) python 3.6 (winmltoolsがpython3.7以降をサポートしていないため) winmltools 1.5.1 skl2onnx 1.7.1 (whlファイルからインポートしてください) その他 (pandas, sklearnなど) 環境(u…

micro:bit情報•2 か月前

micro:bit新着情報(2021/02/07)

sinkinkli（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/257330438/status/1357953201291599874 ツイート:エスビーシーアンドエス(SB C&S) の マイクロビット micro:bit アドバンスセット 知育 STEM プログラミング ガイドブック付 【日本正規代理店品】 MB-B001 https://t.co/ZXHsSrF8wn #タイムセール youichi kato（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/4873281/status/1357945113964466176 ツイート:micro:bit…

micro:bit情報•2 か月前

micro:bit新着情報(2021/02/04)

Vincent Scheib（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/213538363/status/1357032712494698497 ツイート:RT @youtoy: 動画をツイートしていた件、ざっくりな手順を Qiita の記事に書きました。●Web Serial API を最短の手順で試したくてやったこと（micro:bit を利用） - Qiita https://t.co/Gzqlgh3qhL Vincent Scheib（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/213538363/status/135703266788827955…

micro:bit情報•2 か月前

micro:bit新着情報(2021/02/03)

Microbit_greenhouse（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/1257480996305305600/status/1356674517494607873 ツイート:RT @katoy: micro:bit v2 用の tutorial を書き始めてみた。 https://t.co/Q1QKCKdfoF github も使っている。 https://t.co/bALAQEgTuw #MakeCode #microbit basictomonokai（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/1919301649/status/1356…

micro:bit情報•2 か月前

micro:bit新着情報(2021/02/02)

デザインスパーク（日本語）（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/2307557126/status/1356251051091873794 ツイート:RT @RSJapanMK: 【再掲】【新商品】 格安micro:bit 用 街灯ミニチュアキット。 街灯のミニチュアを作成できます。支柱にフォトトランジスタが組み込まれており周囲光レベルを検出し、LEDライトのオンオフを制御するような動作をプログラミングできます。 https… デザインスパーク（日本語）（🐦） ツイートURL:https://twitter.com/2307557126/status/13562421…