偽陽性

先日、大幅に体調を崩した。 夜に激しい頭痛に襲われ、夜中に嘔吐を繰り返し、悪寒が朝まで止まらなかった。「もしかするとコロナに感染したかも？」と思ったけど、熱もなく喉も痛くない。悪寒はするけど。 体調を崩した日の昼に姉に会っていたため、姉に連絡すると「私がコロナに感染してたらどうしてくれるのよ！」とお怒りだったため、仕方なく無料のPCR検査場で検査することにした。 「きっと陰性だろうけど、念の為」と思っていたら陽性だった。 保健所に連絡したら「保健所と繋がっていない無料のPCR検査場が乱立しているため、そこで陽性になっても陽性とは見なされません。再度、病院で検査してください。」とのこと。 PCR…

6日の期限のまん延防止等重点措置が、東京など18都道府県で、21日まで延長となりました。 ◯報道と戯作 ロバート・キャンベルさんによると、日本では、江戸時代にも庶民の識字率を上げるような文教政策として、笑いを込めた教訓ものが、広く流布されていました。 時事報道にも、感染症対策などを教訓を笑いと重ねて伝えていたのです。 1803年「麻疹戯言」は、式亭三馬によって書かれたハシカをめぐる戯言です。 ◯コロナ禍の今 感染症は、発症から時間がたつと重篤性が低下して、感染しても発症させないもの、感染すらしないものになっていくものです。 しかし、今回の新型コロナは、そうなっていません。 科学者も研究者も、そ…

スポンサーリンク // 今朝、目に留まった記事は ドイツのふうこさんのブログのものです。 早速リブログ リンク転載 させていただきますね。 内容は、田中宇さん（国際情勢解説者）による 無料シェア記事からのようです。 ameblo.jp PCR検査については、そもそも 考案者のキャリー・マリス博士（2019年に他界された）が この診断には使えないと話されていたとのことですね。 「PCRを感染症の診断に用いてはならない」 それを一斉に広めて、偽陽性者を増産しているのは 何ともおかしなことで、陽性を感染者とするのは間違いです。 こうして一方的にパンデミックだと煽る一連の流れを見ていると 隠れた意図が…

新型コロナのワクチン接種のスケジュールが、特に医療従事者と65歳以上の高齢者のスケジュールがだんだん明らかになってきている一方、いわゆる「第4波」の新規感染者数の増加がなかなか止まらなくなって来ているようです。 昨年の今頃は日本ではPCR検査は極力行わないと言っていたのが嘘のように、現在はPCR検査の価格破壊とでも言っていいように、わずか数千円でドラッグストアでもできるようになってきました。 そのとき、PCR検査と一口に言いますが、「その検査は同じように手法で同じような基準でやられているのだろうか？」と言う疑問を抱くのは、教授だけではないと思います。qRT-PCR検査と言う意味では確かに同じと…

はじめに 世界保健機構WHOは、今年1月20日、臨床検査の専門家や技師向けに「SARS-CoV-2検出のためのPCRを用いる核酸検査技術」と題する文書をウェブ掲載しました（図1）。目的は、昨年5月に出されていたも情報の更新とさらなる明確化です（今回がバージョン2）。PCR検査の結果については、この指針や検査の指示書を踏まえて解釈すべきとしています。 図1. WHOが掲載したSARS-CoV-2検出のためのPCRを用いる核酸検査技術に関する文書 [1]． 1. WHOが示した検査上の留意点 この文書に第一に挙げられていることは、現行のSARS-CoV-2の標準検査であるプローブ・リアルタイムPC…

PCR検査を開発したキャリーマリス氏が殺される直前に言ったとされる「PCR検査は感染症の判定をするのには適していない」というのは、世間的にはあまり響かなかった… 今度は、サイクル数で追い込んでいきましょうｗ www.youtube.com

こんにちはミヤです そういえばベビちゃんが入院していたときに、新生児マススクリーニングとオプショナルスクリーニング(新規マススクリーニング)をうけました。そのことについて書いていきます。 新生児マススクリーニングとオプショナルスクリーニング 検査結果 再検査の項目 安心材料を探す日々 一時的なもの 哺乳量の不足 再検査の結果 スクリーニングの意義 検査するか迷われてる方へ 新生児マススクリーニングとオプショナルスクリーニング 新生児マススクリーニングやオプショナルスクリーニングは赤ちゃんの先天性の代謝異常や免疫異常を見つける検査です。 検査は踵から血を少し採取して行います。 新生児マススクリー…

R3．1．肺炎球菌尿中抗原が偽陽性となるのはどれか。 a Streptococcus suis b Streptococcus mitis c Enterococcus faecium d Enterococcus faecalis e Streptococcus pyogenes 正解 b 添付文書より ・交差反応：S.mitis以外の連鎖球菌（anginosus，A群，C群，G群，mutans，sanguis）はすべて陰性 ・検出時期は肺炎症状出現後3日目以降，排出される期間は数日から数週間 ・月齢2～60ヶ月の乳幼児で鼻咽頭に肺炎球菌が常在している場合に偽陽性がありえる https://…

外国人観光客の受け入れのためにマスク着用緩和するウンコ政府！ そもそもウイルスが嘘ですからマスクも必要ないしマスク事態にウイルスを防ぐことも出来ないこを隠して今までマスク着用圧力をかけ続けた政府と医療関係者がインバウンドを復活させるためにマスク着用圧力を緩和しだした！ アメリカ、イギリスなど100か国が検査免除ときたもんだ！ これで分かるよね、ウイルスが嘘だったことが！発熱した人はタダの風邪や季節性インフルだつたりインチキPCR検査で全く風邪に感染してない偽陽性者を量産したり 死後にコロナ患者に仕立てたりしてワクチン接種に誘導したのだよ ＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊…

2022年4月27日(水)、新橋駅前で行われた、参政党の街頭演説を書き起こしました。吉野敏明氏の演説です。陰陽五行説について、ざっくりとした基本と、政治やビジネス、そして専門の医療に応用する実例です。「別にね、教養セミナーじゃないの」。有料セミナー級の内容ですが、教養をつけることにとどまらず、現在の医療問題、私たち個人の生活の問題を理解するために、必見・必聴です。参政党は、選挙で議席を取るこどだけを目的とする政党ではないので、このような街頭演説を行っています。

出生前診断て100%じゃないみたい(>_<) 偽陽性ってのがあるらしくて・・・ 赤ちゃんに異常がある場合はもちろん陽性になるんだけど、胎盤に異常がある場合や胎盤と赤ちゃんに半々ずつ異常がある場合、などなど【陽性】にも色々あるらしい・・・ ちなみにフランスでは全員無料で受けられるみたい。いいな。本当日本て遅れてる✈️💨

野暮用で 駐仏日本国大使館に行ってきました。 在外邦人にとってはある種鬼門とも言える 伏魔殿の様な感じにさせられる事が多い場所なのですが そこでしかやってもらえないので 蛮勇をふるって行ってみたのです。 そこで目にしたものは 入り口の長蛇の列。 列を作っている人のほとんどは 日本人ではないので おそらくヴィザの申請と取得のためと思われます。 聞いてはいたものの 日本に入国するのは 今や「至難の技」のようです。 なんと 日本は外国人の入国は未だに「禁止」状態なのだとか。 どうしても日本に入国したければ 「ヴィザ」が必要とか 一体どこの辺境国なのかと。。。 そして 外国人と在外邦人とを問わず 居住…

大規模なシークエンス研究により、一般的な構造バリアント（SV）やレアバリアントなどの遺伝子バリアントと形質や疾患との関連付けが可能になった。SVには、欠失、挿入、重複、50塩基以上のリアレンジメントが含まれ、これらは遺伝的多様性、発達障害、ガンに大きな役割を担っている。SNV などの変異と比較すると、特に SV のサイズとブレークポイントの複雑さが非常に多様であるため、ハイスループットのショートリードデータを用いた SV の検出は歴史的に困難とされてきた。近年、1分子シーケンス（SMS）は、ロングリードまたはそのde novoアセンブリが、特に複雑で反復性のある領域においてSVに及ぶため、高品…

Goのリンターの1つであるstaticcheckのルールを全部読みました。 staticcheck.io 全部書くとただのコピーになってしまうので、その中からかいつまんでいくつか紹介します。 SA1 – Various misuses of the standard library SA1004 - Suspiciously small untyped constant in time.Sleep time.Sleep関数に渡されたtime.Durationはナノ秒単位なので、あまりにも小さい値の場合はバグの原因として注意してくれるようです。他の言語だとこういうAPIの場合ミリ秒とかだったりし…

現在第２子妊娠中で、出生前診断（NIPT）を受けるべきかどうか悩んでいます。第1子のときは20代だったので何も考えず出産まで進んだのですが、現在はちょうど30歳。 まだ若いとはいえ、ダウン症の確率は1/952だそうです。 妻は第1子の出産時、右目の網膜動分枝脈閉塞症を発症し、右目の上半分が見えなくなってしまったので（このときは10万人に1人とも言われました）、1/1000程度は引くときは引く数字だと思うのです。血液検査だけで済むのはノーリスクなので良いですが、一方、非確定的検査なので偽陽性率も高く、陽性と判定されると次は羊水検査になるので、その場合はリスクもあるようです。一方、偽陰性率はほぼゼ…

Childish Gambinoの『This Is America』では描かれなかったアメリカ合衆国以外のアメリカ大陸の主に抵抗の歴史を、歌詞と映像で振り返るという壮大な作品。 Residente - This is Not America [歌詞] 遠い昔、あなたが着いたときには、私たちの足跡は既にそこにありました。彼らは猫の餌まで盗み、そしてまだ皿を舐めています。この恩知らずに腹を立てました。 彼らが私を虐待者扱いするまで、今ドラムを激しく叩いています。あなたが情報を知らないなら、クンビア・ボサノバ・タンゴ・バジェナートを投げつけます。木や竹も、すぐに良くなる。 （西アフリカの都市）トンブ…

同種の微生物細胞が共存すると、栄養嗜好から病原性までの表現型に影響を与える遺伝的変異を示すことが多い。本発表では、メタゲノムのペアエンドリードを用いて、全ゲノムにわたる集団内の遺伝的多様性（マイクロダイバーシティ）をプロファイリングし、マイクロダイバーシティを考慮した方法で微生物集団を比較するプログラムinStrainを紹介する。inStrainは既存の方法とベンチマークした場合のゲノム比較の精度を大幅に向上させる。inStrainを用いて、新生児未熟児の糞便メタゲノム1,000個以上をプロファイリングし、一卵性双生児は二卵性双生児よりも株を共有していないが、兄弟姉妹は無関係な幼児よりも有意に…

2クラス問題の評価指標 ROC曲線 ROC曲線による性能評価 2クラス問題の評価指標 偽陽性率=：陰性のものを陽性と判断した割合 真陽性率=：陽性のものを正しく陽性と判断した割合 正解度=：正しく識別した割合 適合率=：陽性と判断されたものの中で正しく陽性のものの割合 再現率=：真陽性率と定義は同じであるが，真のクラスPの数が分かっていない時にPを推定して求める． F-値=：適合率と再現率の調和平均 ROC曲線 ROC曲線は偽陽性率と真陽性率の関係をグラフにした物である．これは，陽性のデータ数と陰性のデータ数に大きな差があっても影響を受けないという特徴がある． 識別境界を端から端まで動かした時…

いい加減時代の潮流に乗ろうということで機械学習を学びたいと思う。またRはともかくとしてPythonは未経験であるため、丁度良い書籍として統計的機械学習の数理100問 with R (with R) (機械学習の数理100問シリーズ)作者:讓, 鈴木共立出版Amazon統計的機械学習の数理100問 with Python (機械学習の数理100問シリーズ)作者:讓, 鈴木共立出版Amazonを用いることにする。 2. 分類 2.4. k近傍法 2.4.1 Rでのスクリプト 2.4.2 Pythonによるスクリプト*2 2.5 ROC曲線 2. 分類 有限個の数値を目的変数とするような分類の問題を…